137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1990 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  100 
 
 		 266 aa  532  1e-150  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  64.29 
 
 		 307 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  63.4 
 
 		 275 aa  345  6e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  58.87 
 
 		 266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  54.89 
 
 		 266 aa  316  3e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  56.77 
 
 		 304 aa  311  6.999999999999999e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  52.08 
 
 		 268 aa  291  7e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  50.38 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  49.25 
 
 		 266 aa  270  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  42.91 
 
 		 272 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  41.76 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.15 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  40.98 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  40.61 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  38.85 
 
 		 425 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  37.89 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  40.97 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  39.44 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 415 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  37.72 
 
 		 424 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  37.72 
 
 		 415 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  36.05 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  32.84 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  36.43 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35.55 
 
 		 256 aa  119  7e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  29.35 
 
 		 270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  36.46 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.37 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.56 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.66 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.11 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.28 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.32 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.33 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.98 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  26.09 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  25 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.57 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.8 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.63 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  29.96 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  30.43 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.9 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  35.34 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  35.34 
 
 		 568 aa  56.2  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004468  glutamate synthase [NADPH] large chain  31.52 
 
 		 1487 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0526  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.86 
 
 		 1548 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.801021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1954  glutamate synthase subunit alpha  28.19 
 
 		 1487 aa  53.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  27.69 
 
 		 1571 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.56 
 
 		 1551 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  34.88 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  34.88 
 
 		 245 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4501  glutamate synthase subunit alpha  27.27 
 
 		 1486 aa  52.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.22 
 
 		 1530 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3292  glutamate synthase alpha subunit  27.78 
 
 		 228 aa  52  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  27.78 
 
 		 1536 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  26.51 
 
 		 1465 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03077  glutamate synthase, large subunit  31.08 
 
 		 1517 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.427677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0495  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.08 
 
 		 1517 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03028  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1517 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.403109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.57 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.7 
 
 		 1521 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4535  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1517 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5639  glutamate synthase alpha subunit domain protein  27.73 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1294  glutamate synthase (ferredoxin)  26.95 
 
 		 1562 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2165  glutamate synthase subunit alpha  30.23 
 
 		 1487 aa  49.7  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.409887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6576  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.25 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.026671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3405  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1486 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3700  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1486 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0488  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1522 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.690727 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3508  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1517 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3558  glutamate synthase subunit alpha  31.08 
 
 		 1486 aa  49.7  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1874  glutamate synthase subunit alpha  30.23 
 
 		 1487 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  39.19 
 
 		 313 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1869  putative glutamate synthase  24.81 
 
 		 225 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310557  normal  0.791624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5750  formyl-methanofuran dehydrogenase  32.63 
 
 		 228 aa  49.3  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1762  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  43.28 
 
 		 105 aa  48.9  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20710  glutamate synthase (NADH) large subunit  26.12 
 
 		 1524 aa  48.9  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.42786 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6007  glutamate synthase alpha subunit  27.73 
 
 		 228 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.607641  decreased coverage  0.00322278 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.33 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  28.23 
 
 		 572 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  30.4 
 
 		 1507 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.97 
 
 		 1529 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  27.97 
 
 		 1475 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  28.47 
 
 		 1475 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  28.47 
 
 		 1475 aa  48.1  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3633  glutamate synthase subunit alpha  31.3 
 
 		 1486 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1752  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.5 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.216628 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.06 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  29.69 
 
 		 553 aa  47  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2284  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.4 
 
 		 1486 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  28.83 
 
 		 1473 aa  46.6  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3791  glutamate synthase subunit alpha  29.14 
 
 		 1486 aa  46.6  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  32.31 
 
 		 251 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.52 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0265  Glutamate synthase (ferredoxin)  26.9 
 
 		 1487 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.316824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0305  glutamate synthase subunit alpha  28.48 
 
 		 1486 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.910499  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1198  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C (tungsten)  38.14 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.34 
 
 		 1554 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>