138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5997 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5997  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  100 
 
 
265 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5773  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  85.66 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14713  normal  0.931253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0523  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  66.41 
 
 
264 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300278  normal  0.650549 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  68.82 
 
 
265 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  0.875805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2159  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  67.42 
 
 
265 aa  287  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0901303 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1824  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  67.8 
 
 
265 aa  286  4e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.317738  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  45.45 
 
 
268 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  48.28 
 
 
269 aa  185  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  42.61 
 
 
286 aa  175  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  46.64 
 
 
276 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  41.42 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  42.26 
 
 
270 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  39.39 
 
 
272 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.78 
 
 
269 aa  156  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3133  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  43.27 
 
 
281 aa  155  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  41.52 
 
 
281 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1793  glutamate synthase alpha subunit  44.27 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0607708  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  33.49 
 
 
415 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0875  formylmethanofuran dehydrogenase  31.18 
 
 
266 aa  92.4  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.118005  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  34.43 
 
 
415 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1421  glutamate synthase alpha subunit domain protein  28.17 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  28.51 
 
 
425 aa  91.7  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0575  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  33.95 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00575915  decreased coverage  0.000443842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1990  formylmethanofuran dehydrogenase  32.8 
 
 
266 aa  89  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.114316  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  28.39 
 
 
272 aa  89  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0618  formylmethanofuran dehydrogenase  32.8 
 
 
268 aa  88.2  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.031501  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  30.07 
 
 
257 aa  87.8  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  31.49 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  33.96 
 
 
415 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.39 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1473  formylmethanofuran dehydrogenase  32.04 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.143119  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  30.6 
 
 
254 aa  85.5  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0201  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.46 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0127762  normal  0.0655916 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  33.77 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  31.88 
 
 
424 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  31.72 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  25.11 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0370  formylmethanofuran dehydrogenase  32.42 
 
 
266 aa  84  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  27.54 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.8 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0283  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  32.7 
 
 
269 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.363907  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  26.32 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  28.57 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  41.44 
 
 
568 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.92 
 
 
1474 aa  56.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  41.76 
 
 
568 aa  54.7  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1176  glutamate synthase (NADPH) large subunit  32.69 
 
 
1479 aa  54.3  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  36.28 
 
 
572 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  35.19 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  35.19 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0878  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.55 
 
 
1475 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0730  glutamate synthase, large subunit  33.55 
 
 
1475 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  36.46 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0326  glutamate synthase (ferredoxin)  34.03 
 
 
1533 aa  52.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.127491  normal  0.144966 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_51965  predicted protein  36.29 
 
 
1562 aa  52.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.738666  normal  0.0653658 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56605  predicted protein  33.59 
 
 
1697 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0809416  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2016  glutamate synthase (NADPH)  32.37 
 
 
1535 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2275  glutamate synthase, alpha subunit, C-terminal  36.89 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.225316  hitchhiker  0.00959584 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1219  Glutamate synthase (ferredoxin)  36.43 
 
 
1525 aa  50.8  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.589961  normal  0.962678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2584  hypothetical protein  36.89 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0278158  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0890  glutamate synthase (ferredoxin)  33.33 
 
 
1536 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00390315  decreased coverage  0.000127994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3466  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.46 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201288  normal  0.713984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2249  glutamate synthase alpha subunit  35.9 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  30.43 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  29.13 
 
 
245 aa  50.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  37.14 
 
 
1530 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3807  Glutamate synthase (ferredoxin)  33.53 
 
 
1502 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.344591  hitchhiker  0.00201054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0562  glutamate synthase alpha subunit  26.19 
 
 
242 aa  49.3  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0145  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.59 
 
 
1533 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.705237  normal  0.20582 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2340  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.99 
 
 
1483 aa  48.9  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1078  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.83 
 
 
1529 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1339  glutamate synthase alpha subunit  35.65 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.794654 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19531  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.83 
 
 
1475 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1100  glutamate synthase alpha subunit  35.45 
 
 
553 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.154608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  36.19 
 
 
320 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1080  glutamate synthase alpha subunit  31.43 
 
 
263 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3782  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.09 
 
 
1554 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.376942  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0867  glutamate synthase alpha subunit  31.43 
 
 
256 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0287996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1700  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.71 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  40.79 
 
 
250 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1487  glutamate synthase, large subunit  31.01 
 
 
1465 aa  47.8  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0194294  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0201  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  27.78 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1596  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  31.43 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1094  glutamate synthase alpha subunit  29.84 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23581  ferredoxin-dependent glutamate synthase  32.86 
 
 
1527 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.242858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0834  glutamate synthase subunit alpha  30.67 
 
 
1482 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87862  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2633  glutamate synthase alpha subunit domain protein  35.42 
 
 
235 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1117  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.82 
 
 
1468 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1816  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  37.23 
 
 
251 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5920  glutamate synthase alpha subunit  37.97 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.755435  normal  0.413716 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1482  glutamate synthase, large subunit  32.39 
 
 
1473 aa  46.2  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.78 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1235  hypothetical protein  34.41 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2500  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  33.66 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0493584  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1468  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.71 
 
 
1551 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.163376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1982  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.91 
 
 
1521 aa  45.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.349695  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0653  glutamate synthase  31.78 
 
 
1571 aa  45.8  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.58912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2161  glutamate synthase (ferredoxin)  30.77 
 
 
1519 aa  45.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.706434  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0544  glutamate synthase alpha subunit domain protein  36.17 
 
 
281 aa  45.4  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00693523 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1345  glutamate synthase, alpha subunit-like  33.66 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>