50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0525 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0525  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C-like  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.618523  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0878  glutamate synthase alpha subunit  46.15 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.225814  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1607  tungsten containing formylmethanofruran dehydrogenase subunit C-related protein  46.52 
 
 		 313 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1069  glutamate synthase alpha subunit  46.52 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1083  glutamate synthase alpha subunit  42.65 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.386486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1478  hypothetical protein  36.95 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00968841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2708  glutamate synthase alpha subunit domain protein  49.18 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.414191  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1289  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  35.29 
 
 		 245 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000639589 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0029  glutamate synthase alpha subunit domain protein  33.75 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2233  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  26.81 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.0399291 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1692  glutamate synthase alpha subunit  29.2 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.737414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1098  formylmethanofuran dehydrogenase  33.13 
 
 		 257 aa  51.6  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1302  glutamate synthase alpha subunit  38.71 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0211  glutamate synthase alpha subunit  39.34 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1442  formylmethanofuran dehydrogenase  33.33 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.717791  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0563  formylmethanofuran dehydrogenase  30.21 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6507  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  34.82 
 
 		 286 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0305137 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1450  formylmethanofuran dehydrogenase  30.26 
 
 		 415 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0342  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.46 
 
 		 272 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5932  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  35.92 
 
 		 274 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0388185  normal  0.0470213 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1663  formylmethanofuran dehydrogenase  30.61 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2857  formylmethanofurane dehydrogenase subunit, putative  34.91 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000000505673  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0332  glutamate synthase alpha subunit  39.34 
 
 		 245 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.951103  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2464  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  38.37 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0526  glutamate synthase alpha subunit  36.07 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.187094  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0022  formylmethanofuran dehydrogenase  29.09 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0540  glutamate synthase alpha subunit  36.07 
 
 		 245 aa  47.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.800593  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1424  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  29.46 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.176644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2626  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.36 
 
 		 269 aa  46.6  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0030  glutamate synthase alpha subunit  29.73 
 
 		 670 aa  46.6  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  26.32 
 
 		 659 aa  46.2  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3064  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  39.53 
 
 		 276 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0495  formylmethanofuran dehydrogenase  26.53 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.943026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1189  glutamate synthase alpha subunit  28.65 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0663  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  38.33 
 
 		 247 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.358325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0782  glutamate synthase, alpha subunit-like  28.68 
 
 		 246 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00542084  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0246  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  36.67 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.314224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2112  formylmethanofuran dehydrogenase  36.51 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0830  glutamate synthase alpha subunit  30.38 
 
 		 568 aa  44.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.990819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2403  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  32.56 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16290  glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  25.87 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.518041  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1981  formylmethanofuran dehydrogenase  29.55 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.372116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1290  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  35 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0381  formylmethanofuran dehydrogenase subunit C  28.76 
 
 		 415 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0084  formylmethanofuran dehydrogenase  30.23 
 
 		 425 aa  43.1  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1665  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit C  29.57 
 
 		 269 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.477479  normal  0.947493 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1812  glutamate synthase alpha subunit  29.11 
 
 		 568 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000275446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2357  glutamate synthase alpha subunit domain protein  31.25 
 
 		 250 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1607  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit / glutamate synthase (NADPH) GltB3 subunit  32.04 
 
 		 572 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1531  formylmethanofuran dehydrogenase  28.29 
 
 		 415 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000509371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>