More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0295 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0295  endo-1,4-beta-xylanase D  100 
 
 
373 aa  766    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0385637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8726  polysaccharide deacetylase  46 
 
 
307 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  44.38 
 
 
417 aa  166  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  40.89 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  42.08 
 
 
373 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  42.39 
 
 
503 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2251  polysaccharide deacetylase  35.41 
 
 
291 aa  151  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3069  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
465 aa  149  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0662  xylanase/chitin deacetylase-like protein  40.1 
 
 
468 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1621  xylanase/chitin deacetylase  38.92 
 
 
488 aa  145  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  39.06 
 
 
251 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3590  polysaccharide deacetylase  42.02 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.132033  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1147  polysaccharide deacetylase  38.35 
 
 
267 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00801217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  35.34 
 
 
321 aa  140  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2517  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.197208  normal  0.18394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0801  polysaccharide deacetylase  40 
 
 
537 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147243  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
368 aa  137  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  37.14 
 
 
1101 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7981  chitin deacetylase  39.46 
 
 
287 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.365154  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  36.02 
 
 
258 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0720  polysaccharide deacetylase, putative  37.17 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  40.1 
 
 
352 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  39.27 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  36.08 
 
 
522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0110  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000182672  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0800  polysaccharide deacetylase  27.61 
 
 
520 aa  129  8.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.58232 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  37.1 
 
 
256 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1068  xylanase/chitin deacetylase-like protein  38.1 
 
 
244 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.544039  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 
299 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3202  glycosyl transferase and polysaccharide deacetylase fusion  37.06 
 
 
1115 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00982946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  37.06 
 
 
1119 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.06 
 
 
1115 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2297  polysaccharide deacetylase  35.59 
 
 
542 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  37.06 
 
 
927 aa  126  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0652  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
302 aa  126  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.249248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2769  polysaccharide deacetylase  37.31 
 
 
273 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.322155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  37.06 
 
 
1115 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3149  polysaccharide deacetylase  35.32 
 
 
345 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.442211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  37.17 
 
 
242 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  40.72 
 
 
277 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  33.85 
 
 
240 aa  123  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  35.68 
 
 
1115 aa  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  36.04 
 
 
872 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
204 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
247 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2063  polysaccharide deacetylase  37.37 
 
 
248 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0736381 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1185  polysaccharide deacetylase  35.64 
 
 
244 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  35.86 
 
 
301 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  36.51 
 
 
221 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1255  polysaccharide deacetylase  36.26 
 
 
356 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  36.22 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 
283 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1500  polysaccharide deacetylase  38.3 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000768102  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4917  polysaccharide deacetylase  36.32 
 
 
212 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6265  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 
229 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0255  polysaccharide deacetylase  34.43 
 
 
199 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1579  polysaccharide deacetylase  37.91 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  32.34 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2866  polysaccharide deacetylase  38.86 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  35.03 
 
 
1124 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0868  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  36.41 
 
 
250 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0275636  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1638  polysaccharide deacetylase  36.31 
 
 
238 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2833  polysaccharide deacetylase  35.8 
 
 
227 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.163356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
264 aa  116  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11117  glycosyl hydrolase  35.94 
 
 
291 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.886951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  32.18 
 
 
275 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3179  polysaccharide deacetylase  33.87 
 
 
295 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0601  polysaccharide deacetylase  32.46 
 
 
259 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 
275 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 
247 aa  116  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1372  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 
264 aa  115  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  34.87 
 
 
244 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  31.84 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 
871 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  35.08 
 
 
204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  36.13 
 
 
405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4651  polysaccharide deacetylase  34.18 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2061  polysaccharide deacetylase, putative  35.15 
 
 
273 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.13 
 
 
241 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2080  putative polysaccharide deacetylase  35.15 
 
 
273 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000146273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1979  putative polysaccharide deacetylase  34.65 
 
 
273 aa  113  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00191884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1655  polysaccharide deacetylase  31.8 
 
 
244 aa  112  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2788  cellulose-binding family II protein  35 
 
 
364 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.700875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  39.22 
 
 
217 aa  112  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2008  polysaccharide deacetylase  32.63 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000244714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1834  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000185073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1808  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000183162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4661  polysaccharide deacetylase  37.38 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.708136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1977  polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000478204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 
251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2012  putative polysaccharide deacetylase  34.16 
 
 
273 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.46073e-43 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>