More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0009 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1093  phenylacetic acid degradation-related protein  39.52 
 
 
132 aa  88.2  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  39.32 
 
 
153 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  41.23 
 
 
137 aa  84.7  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  37.8 
 
 
148 aa  84.3  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
139 aa  69.7  2e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4125  hypothetical protein  41.94 
 
 
156 aa  69.3  2e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3939  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
179 aa  68.9  2e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2942  thioesterase superfamily protein  41.76 
 
 
135 aa  68.6  4e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0555225  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3656  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
127 aa  68.2  4e-11  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
147 aa  68.2  5e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  1.25506e-15 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 
183 aa  67.4  8e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
137 aa  67.4  8e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0912  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
138 aa  66.6  1e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.511728  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  37.39 
 
 
209 aa  67  1e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
149 aa  66.2  2e-10  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
148 aa  65.9  2e-10  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2573  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 
232 aa  65.5  3e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.686458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3942  thioesterase superfamily protein  38.46 
 
 
191 aa  65.5  3e-10  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10860  hypothetical protein  31.4 
 
 
161 aa  65.1  4e-10  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.405906  unclonable  1.76552e-09 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.21 
 
 
146 aa  65.1  4e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.84 
 
 
134 aa  64.7  5e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5089  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
165 aa  64.7  5e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.765529  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  32.52 
 
 
160 aa  63.2  1e-09  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0301  hypothetical protein  31.93 
 
 
126 aa  63.5  1e-09  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
128 aa  63.2  1e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  31.93 
 
 
127 aa  62.8  2e-09  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0725  thioesterase superfamily protein  37.23 
 
 
159 aa  62.4  2e-09  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
127 aa  62.4  2e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3016  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.76 
 
 
178 aa  62.8  2e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  34.62 
 
 
176 aa  63.2  2e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0315  phenylacetic acid degradation-related protein  31.68 
 
 
187 aa  62.4  3e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5342  hypothetical protein  33.03 
 
 
176 aa  62.4  3e-09  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331699  normal  0.285633 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5253  phenylacetic acid degradation-related protein  33.03 
 
 
176 aa  62.4  3e-09  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
127 aa  62  3e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2872  hypothetical protein  27.87 
 
 
137 aa  62  3e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.791142  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1780  thioesterase superfamily protein  28.67 
 
 
148 aa  61.6  4e-09  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.840019  normal  0.113687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
127 aa  62  4e-09  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1410  phenylacetic acid degradation-related protein  33.9 
 
 
165 aa  61.2  6e-09  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1374  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
159 aa  60.1  1e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  31.71 
 
 
160 aa  60.1  1e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  32.69 
 
 
131 aa  59.7  2e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  1.90297e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
127 aa  59.7  2e-08  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5549  hypothetical protein  36.36 
 
 
179 aa  59.3  2e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1850  phenylacetic acid degradation-like protein  32.2 
 
 
154 aa  59.7  2e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0992108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0190  thioesterase superfamily protein  36.04 
 
 
146 aa  59.3  2e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0970  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
160 aa  58.9  3e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.523818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0837  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 
146 aa  58.9  3e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1837  hypothetical protein  32.46 
 
 
159 aa  58.9  3e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2270  phenylacetic acid degradation-related protein  30.7 
 
 
161 aa  58.5  4e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.552661  normal  0.164654 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1598  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
139 aa  58.5  4e-08  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1809  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
159 aa  58.5  4e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.489553 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0460  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
138 aa  58.2  5e-08  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.88962e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2088  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
148 aa  58.2  5e-08  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.179421  hitchhiker  5.00183e-06 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2903  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.93 
 
 
154 aa  57.8  6e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00325077  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5999  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 
181 aa  57.8  6e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1764  hypothetical protein  33.9 
 
 
144 aa  57.8  6e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101105  normal  0.242168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63860  hypothetical protein  36.08 
 
 
179 aa  57.8  7e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.4 
 
 
127 aa  57.4  8e-08  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6180  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 
159 aa  57  1e-07  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1899  hypothetical protein  31.58 
 
 
159 aa  57  1e-07  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1922  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
159 aa  57  1e-07  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.411154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0470  phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.51 
 
 
150 aa  57  1e-07  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0904963  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2692  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
153 aa  57  1e-07  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.250107  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3567  phenylacetic acid degradation protein PaaI  28.66 
 
 
251 aa  57  1e-07  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.060136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3488  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
144 aa  57  1e-07  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.37364e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2751  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
153 aa  57  1e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00224854  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3413  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
144 aa  57  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.001772  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2354  hypothetical protein  26.27 
 
 
143 aa  56.6  1e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5199  phenylacetic acid degradation-related protein  31.58 
 
 
159 aa  56.6  1e-07  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0876  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
144 aa  55.8  2e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  3.76008e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5308  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
147 aa  56.2  2e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218824  normal  0.0896722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30.09 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1483  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  56.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0188667  normal  0.0358059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  31.93 
 
 
127 aa  55.8  2e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  31.29 
 
 
155 aa  56.2  2e-07  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1696  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  55.8  2e-07  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.533828 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1354  hypothetical protein  32.73 
 
 
138 aa  55.8  2e-07  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2492  phenylacetic acid degradation-related protein  29.91 
 
 
146 aa  55.8  2e-07  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3116  phenylacetic acid degradation protein PaaD  34.19 
 
 
153 aa  55.8  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00121794  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1442  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
144 aa  56.2  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319337  normal  0.023791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2007  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 
135 aa  55.8  2e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
137 aa  55.8  3e-07  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3549  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 
158 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0916225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.04 
 
 
158 aa  55.5  3e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0688  hypothetical protein  35.16 
 
 
146 aa  55.1  4e-07  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68886  hitchhiker  0.00534033 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
126 aa  55.1  4e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.39832e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3611  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
144 aa  55.1  4e-07  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000157158  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3898  thioesterase superfamily protein  32.76 
 
 
135 aa  54.7  5e-07  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1285  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 
169 aa  54.7  5e-07  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0944  thioesterase superfamily protein  44.12 
 
 
170 aa  54.7  6e-07  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
136 aa  54.7  6e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  29.55 
 
 
162 aa  53.9  8e-07  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  35.63 
 
 
129 aa  53.9  9e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>