105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2528 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2528  spore coat assembly protein SafA  100 
 
 		 432 aa  848    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0920  spore coat assembly protein SafA  61.73 
 
 		 538 aa  176  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4324  lysM domain-containing protein  77.59 
 
 		 587 aa  99.4  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4161  spoVID-dependent spore coat assembly factor SafA; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein PspC  77.59 
 
 		 609 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4172  spoVID-dependent spore coat assembly factor; FtsK/SpoIIIE family protein; surface protein  77.59 
 
 		 621 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4507  spore coat assembly protein SafA  77.59 
 
 		 615 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0219196 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4559  spovid-dependent spore coat assembly factor safa; ftsk/spoiiie family protein; surface protein pspc  40 
 
 		 613 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4545  spore coat assembly protein SafA  75.86 
 
 		 604 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3142  spore coat assembly protein SafA  77.59 
 
 		 674 aa  97.1  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.104035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0690  SpoVID-dependent spore coat assembly factor SafA  74.14 
 
 		 631 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.538953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4273  spore coat assembly protein SafA  75.86 
 
 		 721 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4659  lysm domain-containing protein  73.58 
 
 		 582 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00627115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4512  lysM domain-containing protein  73.58 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0704  peptidoglycan-binding LysM  36.78 
 
 		 411 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  48.94 
 
 		 335 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 		 194 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  54.35 
 
 		 327 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  36.76 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.19 
 
 		 637 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  34.57 
 
 		 207 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  50 
 
 		 498 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.24 
 
 		 593 aa  50.8  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  54.55 
 
 		 338 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.24 
 
 		 631 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 		 539 aa  50.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  38.6 
 
 		 142 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4500  Lytic transglycosylase catalytic  47.83 
 
 		 523 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  36.17 
 
 		 465 aa  48.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  42 
 
 		 304 aa  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  47.83 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0508  spore coat assembly protein SafA  46.81 
 
 		 203 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.78 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  43.64 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4490  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 744 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0546  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  46.81 
 
 		 415 aa  47.4  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 123 aa  46.6  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0021  Peptidoglycan-binding LysM  46.67 
 
 		 522 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  47.92 
 
 		 231 aa  46.6  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  42.31 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  39.58 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  31.65 
 
 		 284 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  44 
 
 		 554 aa  46.2  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  32.79 
 
 		 246 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0496  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0756826 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01655  hypothetical protein  42.22 
 
 		 255 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  39.29 
 
 		 751 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  45.45 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  42.55 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.23 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  34.85 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  40.43 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  37.25 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0648  peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 1225 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.323072  normal  0.0929491 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0486  lytic transglycosylase, catalytic  45.65 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.232763  normal  0.0521482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 		 267 aa  44.7  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  37.25 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  37.25 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  39.53 
 
 		 695 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  50 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  42.11 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  42.31 
 
 		 520 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03621  LysM domain-containing protein  38.36 
 
 		 253 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.624755  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0300  Allergen V5/Tpx-1 related  40.43 
 
 		 205 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.022059  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2470  Peptidase M23  45.45 
 
 		 332 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0397928 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  44.44 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  25.64 
 
 		 250 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 130 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1474  hypothetical protein  36.62 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234073  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  46.67 
 
 		 255 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0182  Peptidoglycan-binding LysM  36.96 
 
 		 187 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  28.06 
 
 		 301 aa  44.3  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  39.58 
 
 		 284 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1285  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.3 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0590  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.65 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0600559  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0971  rare lipoprotein A  40.91 
 
 		 204 aa  43.9  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.619688  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  47.73 
 
 		 514 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0982  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000253435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  45.45 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  45.45 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1148  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.91 
 
 		 382 aa  43.9  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0738995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  43.75 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.73 
 
 		 377 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  47.73 
 
 		 266 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1216  NLP/P60 protein  37.5 
 
 		 212 aa  43.5  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000177513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.07 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 556 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  28.87 
 
 		 542 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1636  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 109 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  43.75 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  43.75 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  43.75 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  43.75 
 
 		 265 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  40.43 
 
 		 709 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>