132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0425 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1611  peptidoglycan-binding LysM  97.6 
 
 		 334 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000139366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0425  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 334 aa  697    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0216464  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2818  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  50.98 
 
 		 233 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0569502  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0415  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  50.72 
 
 		 233 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.78 
 
 		 233 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.903617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0822  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.43 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.8 
 
 		 539 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.28 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1417  Peptidoglycan-binding LysM  51.79 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 		 533 aa  57  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 567 aa  55.8  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2497  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  55.1 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  57.45 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  54.17 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  55.32 
 
 		 338 aa  52.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 		 596 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2581  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.15 
 
 		 354 aa  52.8  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000866464  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  54 
 
 		 255 aa  52.8  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2004  LysM domain/BON superfamily protein  52 
 
 		 161 aa  52.8  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3407  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.9 
 
 		 351 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000173531  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2055  peptidoglycan-binding LysM  44.26 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000227262  normal  0.0328069 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.74 
 
 		 843 aa  50.8  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3361  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.28 
 
 		 575 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000479287  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 572 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.57 
 
 		 567 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  57.45 
 
 		 324 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  47.27 
 
 		 261 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  48.94 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2544  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.92 
 
 		 235 aa  49.7  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000466767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  52 
 
 		 405 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0962  hypothetical protein  27.14 
 
 		 579 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 		 579 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00112193  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.03 
 
 		 553 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.369962  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1313  hypothetical protein  35.58 
 
 		 969 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  31.31 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.31 
 
 		 599 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.27 
 
 		 354 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000414044  normal  0.0779521 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0963  hypothetical protein  27.14 
 
 		 579 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3033  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  30.3 
 
 		 591 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2916  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.71 
 
 		 185 aa  47.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  45.1 
 
 		 203 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1050  hypothetical protein  27.14 
 
 		 578 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3311  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 		 591 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3295  S-layer protein, putative  30.3 
 
 		 591 aa  47  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0829  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2982  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  30.3 
 
 		 591 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0872  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.14 
 
 		 348 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0979  peptidoglycan-binding LysM  40.91 
 
 		 651 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.3 
 
 		 591 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.653459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8747  Peptidoglycan-binding LysM  52.63 
 
 		 994 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  32.95 
 
 		 546 aa  47  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3255  LysM domain/BON superfamily protein  48.08 
 
 		 157 aa  47  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  44.26 
 
 		 97 aa  47  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68400  LysM domain/BON superfamily protein  36.36 
 
 		 145 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00863438  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  47.83 
 
 		 216 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  51.02 
 
 		 166 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  54 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2498  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.22 
 
 		 218 aa  46.2  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.11512  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 		 527 aa  46.2  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3710  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 389 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.515953  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2695  peptidoglycan-binding protein  42.11 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1556  Lytic transglycosylase catalytic  31.87 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1352  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 440 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.47776  normal  0.0441198 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0486  CHAP domain-containing protein  55.56 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0271604  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1080  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 		 481 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0499  CHAP domain-containing protein  55.56 
 
 		 334 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000123555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1101  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 		 481 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.299401  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2954  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5853  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.65 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3412  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.65 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000169904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  48.94 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  48 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3716  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 		 575 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.597701  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3692  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.57 
 
 		 575 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00650388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1855  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.06 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.653374  normal  0.622298 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 93 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  44.26 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1548  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 1051 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.637066  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2229  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 1086 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 277 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0367  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0376  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.58 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5918  LysM domain/BON superfamily protein  35.06 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2836  LysM domain/BON superfamily protein  47.17 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380861 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0789  peptidoglycan-binding LysM  46.81 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1891  Lytic transglycosylase catalytic  64.52 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3426  Peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 		 1091 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  39.34 
 
 		 2207 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1450  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.58 
 
 		 185 aa  44.3  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.655683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1869  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  31.06 
 
 		 164 aa  44.7  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0453  LysM domain/BON superfamily protein  46.94 
 
 		 158 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2684  prophage LambdaBa01, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 2  31.63 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 235 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>