More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2617 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 533 aa  1066    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  81.36 
 
 		 532 aa  882    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  81.36 
 
 		 532 aa  880    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  87.24 
 
 		 533 aa  935    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  81.05 
 
 		 533 aa  906    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  75.23 
 
 		 530 aa  827    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  72.1 
 
 		 534 aa  777    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  75.05 
 
 		 530 aa  817    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  54.95 
 
 		 533 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  52.63 
 
 		 533 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  50.85 
 
 		 524 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  46.96 
 
 		 531 aa  464  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  46.97 
 
 		 525 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 		 532 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  45.32 
 
 		 530 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  46.68 
 
 		 533 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  44.36 
 
 		 532 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  45.57 
 
 		 526 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  42.72 
 
 		 533 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  43.2 
 
 		 594 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  43.2 
 
 		 594 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  43.31 
 
 		 532 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  42.88 
 
 		 534 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  42.97 
 
 		 533 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  42.26 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  43.94 
 
 		 533 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  43.28 
 
 		 533 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  42.24 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  42.49 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.3 
 
 		 856 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  42.49 
 
 		 632 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.73 
 
 		 856 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  41.49 
 
 		 625 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.57 
 
 		 853 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  39.17 
 
 		 531 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.19 
 
 		 839 aa  363  4e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  41.89 
 
 		 621 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40.2 
 
 		 632 aa  360  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  42.94 
 
 		 510 aa  359  8e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  39.85 
 
 		 609 aa  359  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  40.55 
 
 		 640 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  40.97 
 
 		 604 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.46 
 
 		 848 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  39.55 
 
 		 532 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  43.09 
 
 		 521 aa  352  8.999999999999999e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  40.94 
 
 		 626 aa  352  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  41.14 
 
 		 554 aa  352  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.08 
 
 		 849 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.45 
 
 		 844 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  41.11 
 
 		 526 aa  350  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  41.92 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  39.63 
 
 		 531 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  39.16 
 
 		 526 aa  350  5e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  40.59 
 
 		 554 aa  349  8e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  41.76 
 
 		 614 aa  348  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  41.34 
 
 		 633 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  38.7 
 
 		 529 aa  347  3e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.12 
 
 		 636 aa  347  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.11 
 
 		 845 aa  346  7e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.93 
 
 		 844 aa  343  2.9999999999999997e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  40.04 
 
 		 535 aa  343  5e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.77 
 
 		 521 aa  342  7e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  37.94 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  38.41 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  38.34 
 
 		 533 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  40.59 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  38.41 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1696  preprotein translocase subunit SecD  39.47 
 
 		 618 aa  340  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  38.89 
 
 		 537 aa  339  8e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.79 
 
 		 623 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  38.62 
 
 		 556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  37.68 
 
 		 534 aa  336  5e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 615 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  36.57 
 
 		 604 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 604 aa  336  5.999999999999999e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  37.61 
 
 		 554 aa  336  5.999999999999999e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  40.49 
 
 		 535 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.3 
 
 		 844 aa  334  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  36.92 
 
 		 532 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  39 
 
 		 621 aa  333  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  46.08 
 
 		 473 aa  332  1e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  39.8 
 
 		 554 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  40.08 
 
 		 522 aa  332  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  39.48 
 
 		 627 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  37.83 
 
 		 599 aa  332  1e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1313  preprotein translocase subunit SecD  35.82 
 
 		 616 aa  331  2e-89  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.198401  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1303  protein-export membrane protein SecD  39.43 
 
 		 622 aa  331  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 		 604 aa  331  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  36.33 
 
 		 615 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 		 615 aa  330  4e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  35.78 
 
 		 615 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1331  protein-export membrane protein SecD  39.33 
 
 		 625 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0264501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>