More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4903 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
359 aa  733    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  53.52 
 
 
366 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  52.96 
 
 
375 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  43.02 
 
 
347 aa  272  8.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  41.87 
 
 
369 aa  269  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 
347 aa  250  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  40.28 
 
 
349 aa  249  7e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  40.8 
 
 
355 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  39.84 
 
 
370 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  39.83 
 
 
347 aa  236  6e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  37.64 
 
 
366 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.64 
 
 
372 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.97 
 
 
366 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 
368 aa  225  9e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  38.83 
 
 
328 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  40.48 
 
 
331 aa  222  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  35.57 
 
 
368 aa  220  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  37.54 
 
 
342 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 
470 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  36.77 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 
475 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  35.04 
 
 
375 aa  218  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  36.21 
 
 
374 aa  216  7e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 
413 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  36.74 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  35.93 
 
 
460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  35.93 
 
 
460 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.61 
 
 
401 aa  211  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.26 
 
 
380 aa  211  2e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 
372 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.97 
 
 
346 aa  208  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.87 
 
 
393 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 
406 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  34.96 
 
 
410 aa  202  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  34.52 
 
 
390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  39.27 
 
 
346 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 
404 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  37.88 
 
 
395 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  33.71 
 
 
373 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  36.42 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
372 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  35.85 
 
 
334 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 
414 aa  195  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.4 
 
 
396 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  33.93 
 
 
381 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  34.89 
 
 
393 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  37.18 
 
 
349 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  37.18 
 
 
349 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 
393 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 
378 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.55 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  34.4 
 
 
372 aa  189  7e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  37.16 
 
 
363 aa  188  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1512  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 
405 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  33.78 
 
 
400 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  36.09 
 
 
385 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
422 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  31.83 
 
 
373 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  32.71 
 
 
423 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.37 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  32.78 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1802  HlyD family secretion protein  35.73 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1644  HlyD family secretion protein  35.73 
 
 
395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.37153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  31.71 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  32.88 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2795  secretion protein HlyD family protein  35.11 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.758551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  31.43 
 
 
355 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1624  HlyD family secretion protein  35.46 
 
 
395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  33.33 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  34.47 
 
 
365 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0690  putative multidrug resistance protein  35.46 
 
 
395 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0883  multidrug resistance protein, putative  35.46 
 
 
395 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.919902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1408  putative multidrug resistance protein  35.46 
 
 
395 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0468  putative multidrug resistance protein  35.46 
 
 
395 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  34.17 
 
 
467 aa  182  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6561  secretion protein HlyD family protein  34.04 
 
 
397 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0560581  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  33.72 
 
 
344 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 
374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  33.04 
 
 
374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 
358 aa  181  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 
374 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0516  secretion protein HlyD family protein  35.42 
 
 
389 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  31.14 
 
 
387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  31.43 
 
 
387 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  30.22 
 
 
443 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  33.98 
 
 
463 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  34.4 
 
 
390 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4287  secretion protein HlyD family protein  35.47 
 
 
374 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0584309  normal  0.408904 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  34.01 
 
 
394 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  31.58 
 
 
341 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
352 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  33.91 
 
 
371 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4968  secretion protein HlyD  35.47 
 
 
374 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
352 aa  179  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3192  secretion protein HlyD family protein  35.47 
 
 
374 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  33.43 
 
 
352 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  33.14 
 
 
352 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  32.22 
 
 
391 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>