More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0091 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  76.85 
 
 		 449 aa  664    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  76.8 
 
 		 448 aa  681    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  76.8 
 
 		 448 aa  681    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 445 aa  888    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  72.52 
 
 		 441 aa  653    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  79.15 
 
 		 445 aa  695    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  69.44 
 
 		 471 aa  631  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  60.83 
 
 		 440 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  53.76 
 
 		 451 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  55.24 
 
 		 423 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  54.3 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  55.26 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  53.97 
 
 		 440 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  54.34 
 
 		 456 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  55.16 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  52.58 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  53.6 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  54.04 
 
 		 457 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  53.65 
 
 		 452 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  53.15 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  53.15 
 
 		 440 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  52.93 
 
 		 440 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  52.93 
 
 		 453 aa  426  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  51.49 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  58.42 
 
 		 424 aa  422  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  53.81 
 
 		 440 aa  425  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  55.77 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  52.62 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  58.42 
 
 		 424 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  53.75 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0643  carboxyl-terminal protease  50.56 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  52.31 
 
 		 444 aa  408  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  50.56 
 
 		 463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  52.87 
 
 		 444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  57.82 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  50.91 
 
 		 444 aa  403  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  51.11 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2796  carboxyl-terminal protease  50.99 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  50.74 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  47.92 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  49.64 
 
 		 462 aa  376  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  50.75 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 468 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  47.8 
 
 		 461 aa  373  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  47.86 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  50.39 
 
 		 472 aa  371  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 438 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  48.24 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  48.54 
 
 		 445 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  46.06 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  47.63 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  50 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  50 
 
 		 439 aa  364  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  50.5 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  47.44 
 
 		 462 aa  363  3e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  46.29 
 
 		 452 aa  362  9e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  49.25 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  49.75 
 
 		 436 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  48.51 
 
 		 445 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  46.41 
 
 		 455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  49.25 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  45.99 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  47.94 
 
 		 463 aa  355  5.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  49.45 
 
 		 457 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  45.85 
 
 		 444 aa  349  7e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  46.88 
 
 		 426 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  44.84 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  43.51 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  44.58 
 
 		 444 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  43.87 
 
 		 444 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  46.17 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  46.17 
 
 		 445 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  41.92 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  42.66 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  43.39 
 
 		 438 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  44.2 
 
 		 483 aa  331  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  43.34 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  42 
 
 		 444 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  43.68 
 
 		 450 aa  329  7e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  41.03 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  43.29 
 
 		 439 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0944  carboxyl-terminal protease  43.23 
 
 		 437 aa  326  5e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000279506  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  42.86 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  42.73 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  41.95 
 
 		 476 aa  319  5e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  42.5 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  42.99 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  40.67 
 
 		 444 aa  318  2e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1401  carboxyl-terminal protease  39.69 
 
 		 439 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000562456  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  44.8 
 
 		 440 aa  317  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  42.89 
 
 		 458 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  40.75 
 
 		 444 aa  315  7e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  42.17 
 
 		 515 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0593  carboxyl-terminal protease  47.3 
 
 		 446 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  44.09 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  44.09 
 
 		 482 aa  312  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  43.46 
 
 		 522 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  43.82 
 
 		 481 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>