More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1814 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 376 aa  762    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  77.66 
 
 		 375 aa  595  1e-169  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  37.35 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  36.76 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  36.83 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  35.67 
 
 		 344 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  53.29 
 
 		 447 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  53.95 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  53.64 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  53.64 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  51.77 
 
 		 420 aa  151  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  51.68 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  49.66 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  51.68 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  51.7 
 
 		 351 aa  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  50 
 
 		 345 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1976  OmpA/MotB domain protein  32.55 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0825703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  50 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  52.45 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  40.93 
 
 		 427 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  52.14 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  52.14 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  50.68 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  48 
 
 		 401 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  49.32 
 
 		 337 aa  132  9e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  48.63 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  49.32 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  45.7 
 
 		 333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  44.97 
 
 		 417 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  46.05 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  43.05 
 
 		 345 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  45.07 
 
 		 319 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  45.39 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  45.21 
 
 		 209 aa  123  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  43.62 
 
 		 380 aa  123  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  53.45 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  55.86 
 
 		 210 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.1 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 403 aa  119  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.76 
 
 		 240 aa  116  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  49.53 
 
 		 466 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 244 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  50.47 
 
 		 454 aa  113  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2018  OmpA/MotB  46.27 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  51.43 
 
 		 457 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  40 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 239 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.04 
 
 		 264 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  51.4 
 
 		 459 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  41.84 
 
 		 230 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1086  OmpA/MotB domain-containing protein  46.73 
 
 		 314 aa  107  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  43.26 
 
 		 231 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 445 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.42 
 
 		 237 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  48.6 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  36.81 
 
 		 201 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  39.87 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  42.36 
 
 		 348 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  50.49 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  47.66 
 
 		 466 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 230 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 230 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 		 443 aa  102  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  37.84 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  43.41 
 
 		 226 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 202 aa  102  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  39.04 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  39.86 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 		 202 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  36.54 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  46.22 
 
 		 236 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  39.04 
 
 		 369 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 185 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  39.47 
 
 		 368 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 		 230 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0051  OmpA/MotB domain protein  45.37 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000573223 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  40.52 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  50.48 
 
 		 219 aa  99.8  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 202 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 202 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  37.41 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  39.86 
 
 		 314 aa  99.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  42.21 
 
 		 373 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  34.87 
 
 		 352 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  49.52 
 
 		 218 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 		 219 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 373 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  49.52 
 
 		 218 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  40.85 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  49.09 
 
 		 242 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  49.52 
 
 		 241 aa  97.8  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  39.31 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>