More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3931 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3931  tRNA pseudouridine synthase B  100 
 
 		 299 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.486039  normal  0.358321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4983  tRNA pseudouridine synthase B  55.03 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2319  tRNA pseudouridine synthase B  54.33 
 
 		 301 aa  321  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.163994  hitchhiker  0.00744574 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3977  tRNA pseudouridine synthase B  56.04 
 
 		 291 aa  317  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.505383  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1288  tRNA pseudouridine synthase B  50.98 
 
 		 308 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5113  tRNA pseudouridine synthase B  52.79 
 
 		 308 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.679584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1317  tRNA pseudouridine synthase B  50.49 
 
 		 308 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.583255 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1222  tRNA pseudouridine synthase B  50.84 
 
 		 294 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.732593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0543  tRNA pseudouridine synthase B  43.33 
 
 		 302 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0888324  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05391  tRNA pseudouridine synthase B  42.8 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2131  tRNA pseudouridine synthase B  42 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal  0.419239 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0479  tRNA pseudouridine synthase B  53.49 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14011  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  37.5 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.276631 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1445  tRNA pseudouridine synthase B  38.28 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15081  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  38 
 
 		 305 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.976573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1053  tRNA pseudouridine synthase B  43.92 
 
 		 305 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253025  hitchhiker  0.00000016309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0918  tRNA pseudouridine synthase B  35.69 
 
 		 314 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17741  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.37 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.971864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0781  tRNA pseudouridine synthase B  44.36 
 
 		 293 aa  209  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  45.8 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15331  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  35.67 
 
 		 305 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.765679  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15481  putative tRNA pseudouridine 55 synthase  36.09 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  43.45 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1514  tRNA pseudouridine synthase B  44.03 
 
 		 336 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  44.94 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  43.98 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  42.98 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  44.62 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3589  tRNA pseudouridine synthase B  46.85 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0304508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  42.4 
 
 		 304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  42.73 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2329  tRNA pseudouridine synthase B  49.3 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0208892 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12806  tRNA pseudouridine synthase B  46.98 
 
 		 298 aa  195  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.107563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2158  tRNA pseudouridine synthase B  41.88 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.285493  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  39.85 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  44.66 
 
 		 293 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1424  tRNA pseudouridine synthase B  42.97 
 
 		 306 aa  192  8e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2095  tRNA pseudouridine synthase B  47.69 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2078  tRNA pseudouridine synthase B  47.69 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0804076  normal  0.193911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2141  tRNA pseudouridine synthase B  47.69 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.024046 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1065  tRNA pseudouridine synthase B  45.37 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.362733  normal  0.0143868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3725  tRNA pseudouridine synthase B  37.87 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0838427 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5115  tRNA pseudouridine synthase B  44.09 
 
 		 310 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135033  normal  0.0750927 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  45.04 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0640  tRNA pseudouridine synthase B  38.74 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.951154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  42.75 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0903  pseudouridylate synthase  45.83 
 
 		 299 aa  189  7e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2120  tRNA pseudouridine 55 synthase  45.13 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1213  tRNA pseudouridine synthase B  43.08 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2695  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1108  tRNA pseudouridine synthase B  44.3 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.610694  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07870  tRNA pseudouridine 55 synthase  43.19 
 
 		 303 aa  185  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2921  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 341 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0697495  normal  0.0719894 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1432  tRNA pseudouridine synthase B  39.7 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000149867 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  39.45 
 
 		 302 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  41.47 
 
 		 300 aa  185  9e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10340  tRNA pseudouridine synthase B  49.53 
 
 		 318 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.182635  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2817  tRNA pseudouridine synthase B  37.21 
 
 		 341 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1937  tRNA pseudouridine synthase B  35.86 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  39.31 
 
 		 302 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5828  tRNA pseudouridine synthase B  45.58 
 
 		 299 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.786623  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1186  tRNA pseudouridine synthase B  48.57 
 
 		 313 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.372827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3848  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3821  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.83095e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3661  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00496834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3947  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.70676  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1727  tRNA pseudouridine synthase B  46.23 
 
 		 297 aa  182  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  36.76 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3569  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0427188  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  40.15 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  37.68 
 
 		 305 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4620  tRNA pseudouridine synthase B  36.88 
 
 		 335 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1703  tRNA pseudouridine synthase B  40 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000149412 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2227  tRNA pseudouridine synthase B  46.79 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00164056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3551  tRNA pseudouridine synthase B  38.19 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2922  tRNA pseudouridine synthase B  42.54 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680034  normal  0.150523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3908  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.857105  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14640  tRNA pseudouridine synthase B  46.95 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282471  normal  0.813553 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  42.74 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4028  tRNA pseudouridine synthase B  47.17 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.150764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3188  tRNA pseudouridine synthase B  44.91 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0863622  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1904  tRNA pseudouridine synthase B  38.76 
 
 		 310 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000415787  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1655  tRNA pseudouridine synthase B  35.46 
 
 		 294 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3857  tRNA pseudouridine synthase B  37.8 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000159837  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07030  tRNA pseudouridine synthase B  43.93 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2609  tRNA pseudouridine synthase B  37.42 
 
 		 354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  44.34 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  38.91 
 
 		 307 aa  179  4.999999999999999e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1512  tRNA pseudouridine synthase B  48.8 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.467082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2562  tRNA pseudouridine synthase B  35.37 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0616361  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2293  tRNA pseudouridine synthase B  37.5 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3048  tRNA pseudouridine synthase B  39.23 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  36.54 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  43.1 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1291  tRNA pseudouridine synthase B  37.79 
 
 		 314 aa  177  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.227253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0287  tRNA pseudouridine synthase B  38.17 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  36.27 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>