More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1373 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  61.08 
 
 		 1959 aa  2082    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1917 aa  3881    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  90.01 
 
 		 1669 aa  3090    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  89.61 
 
 		 1942 aa  3094    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  84.56 
 
 		 1840 aa  2959    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  28.32 
 
 		 2096 aa  416  1e-114  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.29 
 
 		 3027 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  27.3 
 
 		 2035 aa  346  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.26 
 
 		 1271 aa  326  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25 
 
 		 2149 aa  314  9e-84  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 2942 aa  295  6e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  26.35 
 
 		 1352 aa  273  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.63 
 
 		 2277 aa  269  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.2 
 
 		 3273 aa  252  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.41 
 
 		 1614 aa  250  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.27 
 
 		 1485 aa  244  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.58 
 
 		 3689 aa  240  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.15 
 
 		 1953 aa  238  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1600 aa  226  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  27.02 
 
 		 1576 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 3193 aa  221  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.22 
 
 		 2731 aa  221  8.999999999999998e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1520 aa  219  5e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1550 aa  218  9e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.16 
 
 		 1572 aa  217  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 1611 aa  216  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1547 aa  213  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  25.57 
 
 		 1560 aa  213  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1527 aa  213  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.79 
 
 		 1384 aa  211  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1586 aa  210  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  27.73 
 
 		 2003 aa  209  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1595 aa  209  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.77 
 
 		 1551 aa  208  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 2374 aa  205  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.81 
 
 		 1467 aa  203  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.18 
 
 		 1485 aa  195  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.53 
 
 		 1197 aa  191  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.87 
 
 		 1488 aa  189  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.29 
 
 		 1552 aa  185  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.48 
 
 		 1259 aa  185  8.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  26.2 
 
 		 924 aa  184  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  24.29 
 
 		 1543 aa  184  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  26.12 
 
 		 1568 aa  184  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1390 aa  183  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 2294 aa  182  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.55 
 
 		 1381 aa  180  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.12 
 
 		 927 aa  181  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  24.06 
 
 		 1518 aa  179  7e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.48 
 
 		 1609 aa  177  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 3073 aa  177  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.5 
 
 		 1464 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.52 
 
 		 1508 aa  176  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.15 
 
 		 1639 aa  175  7.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.33 
 
 		 1593 aa  174  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  29.27 
 
 		 2225 aa  174  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  23.76 
 
 		 1446 aa  173  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.12 
 
 		 1385 aa  173  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  29.66 
 
 		 2178 aa  172  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.58 
 
 		 1362 aa  171  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  26.93 
 
 		 738 aa  171  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.92 
 
 		 1400 aa  170  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  29.38 
 
 		 2221 aa  170  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1531 aa  169  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.26 
 
 		 1517 aa  169  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  23.7 
 
 		 1428 aa  169  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  22.95 
 
 		 1673 aa  168  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  23.7 
 
 		 1579 aa  168  8e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.35 
 
 		 1492 aa  167  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.03 
 
 		 1679 aa  167  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1466 aa  166  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1433 aa  166  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  28.93 
 
 		 2246 aa  166  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.94 
 
 		 1732 aa  165  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  22.45 
 
 		 2486 aa  164  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  29.2 
 
 		 2224 aa  164  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  29.2 
 
 		 2224 aa  164  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  29.03 
 
 		 2224 aa  162  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.2 
 
 		 690 aa  163  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.89 
 
 		 1495 aa  162  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1386 aa  161  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1411 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.12 
 
 		 678 aa  160  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 866 aa  160  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 1410 aa  159  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1541 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1541 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1541 aa  159  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  22.8 
 
 		 1381 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  23.29 
 
 		 1421 aa  159  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.24 
 
 		 1527 aa  158  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.09 
 
 		 1541 aa  158  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.56 
 
 		 1348 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  26.57 
 
 		 2349 aa  157  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25.66 
 
 		 1379 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  26.14 
 
 		 2658 aa  157  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1409 aa  156  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1149 aa  156  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1565 aa  156  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1565 aa  156  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>