More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2473 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
240 aa  480  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  42.2 
 
 
249 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  42.2 
 
 
249 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  42.59 
 
 
249 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  42.59 
 
 
249 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  42.59 
 
 
249 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
253 aa  154  9e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
251 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  40.26 
 
 
274 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  42.13 
 
 
253 aa  152  3e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
255 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 
253 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 
253 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 
249 aa  147  2e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 
249 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
254 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  41.67 
 
 
249 aa  146  4e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  42.79 
 
 
255 aa  145  4e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  39.45 
 
 
253 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  41.55 
 
 
273 aa  143  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  41.62 
 
 
273 aa  142  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  9.57079e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  41.23 
 
 
284 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  40.35 
 
 
242 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  41.82 
 
 
268 aa  141  1e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 
247 aa  140  2e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  43.69 
 
 
248 aa  140  2e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  39.46 
 
 
242 aa  140  2e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
247 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  39 
 
 
244 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  38.99 
 
 
272 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  38.99 
 
 
268 aa  138  8e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  40.72 
 
 
252 aa  138  9e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
270 aa  137  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  41.46 
 
 
262 aa  137  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  43.96 
 
 
247 aa  136  3e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  39.29 
 
 
249 aa  135  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  40.36 
 
 
237 aa  135  6e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  39.91 
 
 
237 aa  134  1e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  39.21 
 
 
250 aa  134  1e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  36.94 
 
 
246 aa  134  2e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  39.19 
 
 
251 aa  133  2e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  40.62 
 
 
299 aa  132  4e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 
272 aa  131  1e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  39.64 
 
 
251 aa  131  1e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  42.27 
 
 
232 aa  130  2e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  33.33 
 
 
248 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  32.47 
 
 
246 aa  128  8e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  40.65 
 
 
236 aa  126  2e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  39.37 
 
 
236 aa  125  8e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
251 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  39.17 
 
 
264 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.13 
 
 
250 aa  122  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
237 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  38.36 
 
 
236 aa  122  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  41.49 
 
 
244 aa  121  1e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
246 aa  121  1e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  36 
 
 
248 aa  120  1e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 
246 aa  121  1e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.91 
 
 
241 aa  117  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 
245 aa  117  2e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 
240 aa  117  2e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
230 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 
235 aa  115  7e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  37.34 
 
 
260 aa  114  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  40.54 
 
 
234 aa  114  1e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.62 
 
 
238 aa  114  2e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  35.84 
 
 
230 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3401  GntR domain-containing protein  43.04 
 
 
233 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334761  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
247 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 
238 aa  112  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
288 aa  112  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
259 aa  112  7e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  8.56086e-05  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  41.58 
 
 
233 aa  111  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  34.63 
 
 
230 aa  111  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  40.99 
 
 
258 aa  111  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  40.83 
 
 
233 aa  111  1e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
249 aa  110  2e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  38.01 
 
 
243 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  39.91 
 
 
234 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1308  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
240 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  36.07 
 
 
275 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  39.91 
 
 
234 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
255 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  1.69252e-07 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  37.07 
 
 
264 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  38.01 
 
 
224 aa  106  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  35.98 
 
 
253 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  35.83 
 
 
253 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.72 
 
 
227 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 
251 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 
234 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  35.48 
 
 
252 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  32.22 
 
 
258 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  37.84 
 
 
226 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  2.53482e-06 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
250 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  38.6 
 
 
242 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  32.24 
 
 
215 aa  101  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.43 
 
 
245 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.85286e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 
253 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  36.57 
 
 
233 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  31.13 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>