More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3975 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 1026 aa  2077    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  49.25 
 
 		 953 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  48.3 
 
 		 1101 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  36.87 
 
 		 449 aa  115  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  38.64 
 
 		 320 aa  114  9e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  38.69 
 
 		 296 aa  105  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.96 
 
 		 261 aa  102  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  37.4 
 
 		 525 aa  102  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.48 
 
 		 440 aa  102  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  36.96 
 
 		 670 aa  101  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  101  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 262 aa  100  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  39.23 
 
 		 424 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  41.96 
 
 		 263 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.43 
 
 		 623 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  42.31 
 
 		 306 aa  99.4  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 673 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.45 
 
 		 694 aa  98.2  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  42.57 
 
 		 388 aa  97.4  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 537 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 537 aa  97.8  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  43.56 
 
 		 321 aa  95.9  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.15 
 
 		 478 aa  96.3  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 		 364 aa  95.9  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  40.74 
 
 		 215 aa  95.1  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  37.76 
 
 		 505 aa  95.1  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  44.23 
 
 		 402 aa  94.7  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06760  outer membrane protein  38.76 
 
 		 918 aa  94.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 218 aa  94.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 440 aa  94  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2617  OmpA family protein  43.27 
 
 		 225 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.19379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  37.9 
 
 		 1987 aa  93.2  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.02 
 
 		 331 aa  93.6  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  43.48 
 
 		 420 aa  93.6  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 498 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  40.95 
 
 		 266 aa  92.8  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  35.92 
 
 		 704 aa  92  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  41.67 
 
 		 630 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  41.18 
 
 		 294 aa  91.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  40.18 
 
 		 263 aa  91.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  39.62 
 
 		 261 aa  91.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 490 aa  91.3  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  43.88 
 
 		 586 aa  91.3  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  41.67 
 
 		 380 aa  91.3  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  32.73 
 
 		 506 aa  91.3  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.6 
 
 		 337 aa  90.9  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3475  OmpA/MotB domain-containing protein  39.05 
 
 		 221 aa  90.5  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  41.44 
 
 		 352 aa  90.5  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  43 
 
 		 333 aa  90.5  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  41.12 
 
 		 620 aa  90.9  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  34.18 
 
 		 344 aa  90.1  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  38.4 
 
 		 337 aa  90.5  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1973  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 311 aa  89.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  37.59 
 
 		 543 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.81 
 
 		 669 aa  90.5  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 374 aa  90.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 224 aa  89.7  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  42 
 
 		 429 aa  89.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  40.18 
 
 		 260 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  35.71 
 
 		 261 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  32.91 
 
 		 344 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 		 427 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 264 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0318  OmpA/MotB domain-containing protein  37.21 
 
 		 174 aa  89.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0137068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.67 
 
 		 609 aa  89.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 335 aa  89.4  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  37.6 
 
 		 319 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  35.71 
 
 		 261 aa  89.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0546  OmpA/MotB domain-containing protein  33.61 
 
 		 205 aa  89.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.42623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  39.6 
 
 		 422 aa  89.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 169 aa  89  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 1755 aa  89  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 		 459 aa  88.6  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  35.88 
 
 		 244 aa  88.2  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.45 
 
 		 510 aa  88.6  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  40.37 
 
 		 903 aa  88.2  7e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  41.58 
 
 		 330 aa  88.2  7e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003729  outer membrane protein  35.65 
 
 		 222 aa  88.2  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.113552  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  38.83 
 
 		 415 aa  87.8  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  32.69 
 
 		 351 aa  87.4  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  39.29 
 
 		 260 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  39.81 
 
 		 217 aa  87.8  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  34.17 
 
 		 218 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  33.94 
 
 		 427 aa  87.4  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  36.54 
 
 		 707 aa  87.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1152  OmpA family protein  39.62 
 
 		 233 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000620554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  42.31 
 
 		 729 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  36.17 
 
 		 542 aa  87.4  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  32.69 
 
 		 350 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 217 aa  87.4  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  32.69 
 
 		 350 aa  87.4  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 638 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.62 
 
 		 230 aa  87  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  33.58 
 
 		 239 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  39.62 
 
 		 229 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  38.68 
 
 		 375 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 481 aa  86.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.17 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1654  OmpA/MotB domain-containing protein  39.64 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000122259  normal  0.141809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>