145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1799 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 551 aa  1103    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  65.1 
 
 		 510 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  62.34 
 
 		 648 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  58.9 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  65.1 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  61.4 
 
 		 613 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  69.05 
 
 		 460 aa  364  3e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  64.43 
 
 		 467 aa  361  2e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  59.53 
 
 		 420 aa  353  5e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  32.11 
 
 		 846 aa  216  8e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  36.42 
 
 		 360 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  36.42 
 
 		 360 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  36.42 
 
 		 360 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  36.12 
 
 		 360 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  37.23 
 
 		 543 aa  207  4e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  33.56 
 
 		 680 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  30.93 
 
 		 848 aa  203  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  36.83 
 
 		 360 aa  202  9e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  37.23 
 
 		 360 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  37.42 
 
 		 360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  36.34 
 
 		 360 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  37.12 
 
 		 360 aa  200  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  34.65 
 
 		 846 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  35.26 
 
 		 846 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  59.54 
 
 		 652 aa  183  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  33.24 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  32.28 
 
 		 1362 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  32.74 
 
 		 1578 aa  140  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  29.57 
 
 		 729 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  29.57 
 
 		 729 aa  123  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  29.64 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1053  hypothetical protein  41.92 
 
 		 514 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 727 aa  115  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  29.58 
 
 		 699 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  27.32 
 
 		 598 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1049  hypothetical protein  38.82 
 
 		 599 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.17037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  30.18 
 
 		 516 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  28.39 
 
 		 492 aa  104  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3736  chitinase D  38.6 
 
 		 174 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.61469e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  40.48 
 
 		 189 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4407  hypothetical protein  40.82 
 
 		 245 aa  101  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.54 
 
 		 639 aa  101  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  26.97 
 
 		 471 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  26.97 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.57 
 
 		 551 aa  97.8  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  26.3 
 
 		 483 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  25.93 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  27.42 
 
 		 484 aa  94.7  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  26.63 
 
 		 803 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  26.8 
 
 		 353 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  43.9 
 
 		 793 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1117  hypothetical protein  28.36 
 
 		 782 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1121  hypothetical protein  28.52 
 
 		 782 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  64.86 
 
 		 940 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  40 
 
 		 848 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1459  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  59.57 
 
 		 261 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  61.9 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  45.59 
 
 		 790 aa  68.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  39.52 
 
 		 1657 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  37.96 
 
 		 1756 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  65.85 
 
 		 245 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  66.67 
 
 		 285 aa  66.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  60.47 
 
 		 271 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  35.46 
 
 		 878 aa  65.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  56.25 
 
 		 492 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  34.75 
 
 		 878 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  59.52 
 
 		 244 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  39.78 
 
 		 521 aa  63.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  57.45 
 
 		 561 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  58.7 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  58.54 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.92 
 
 		 788 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.92 
 
 		 788 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  35.92 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.92 
 
 		 788 aa  59.7  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  34.95 
 
 		 788 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  34.95 
 
 		 788 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.95 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  52.83 
 
 		 356 aa  59.3  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  35.92 
 
 		 788 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.95 
 
 		 788 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  62.86 
 
 		 1077 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  55.81 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3182  hypothetical protein  23.86 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000313674  decreased coverage  0.00000145488 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  40.34 
 
 		 715 aa  57.8  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  41.18 
 
 		 1226 aa  57.8  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  36.11 
 
 		 14944 aa  57.4  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  56.1 
 
 		 262 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  47.76 
 
 		 1937 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  30.73 
 
 		 878 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  55.81 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  35.04 
 
 		 758 aa  54.3  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04330  putative carbohydrate-binding protein with Ig-like domain and F5/8 type C domain  38.27 
 
 		 1197 aa  53.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.647548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  40.82 
 
 		 1825 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  48.84 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 		 266 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  58.33 
 
 		 543 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 790 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  24.38 
 
 		 1113 aa  51.6  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>