175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0139 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  49.12 
 
 		 894 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2360  glycoside hydrolase family protein  50.98 
 
 		 928 aa  733    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  46.07 
 
 		 961 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2399  glycoside hydrolase family 9  48.81 
 
 		 984 aa  748    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.466816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0735  glycoside hydrolase family 9  50.35 
 
 		 757 aa  700    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.15204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1648  glycoside hydrolase family 9  47.41 
 
 		 949 aa  646    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0139  glycoside hydrolase family 9  100 
 
 		 854 aa  1725    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.877258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  40.36 
 
 		 789 aa  452  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  37.36 
 
 		 778 aa  410  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  42.81 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  35.41 
 
 		 707 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 846 aa  382  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1249  glycoside hydrolase family 9  34 
 
 		 686 aa  350  5e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000227885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.11 
 
 		 887 aa  348  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  33.8 
 
 		 794 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1865  glycoside hydrolase family 9  34.52 
 
 		 1369 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.56874  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  34.4 
 
 		 736 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  37.19 
 
 		 880 aa  331  3e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  33.79 
 
 		 710 aa  324  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  34.53 
 
 		 739 aa  323  7e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  32.31 
 
 		 742 aa  317  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  33 
 
 		 1759 aa  304  5.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  33.94 
 
 		 725 aa  302  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  36.2 
 
 		 990 aa  302  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 730 aa  296  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  31.98 
 
 		 985 aa  293  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  31.36 
 
 		 715 aa  289  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  31.43 
 
 		 847 aa  282  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  34.04 
 
 		 526 aa  279  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0734  glycoside hydrolase family 9  33.28 
 
 		 737 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  34.37 
 
 		 563 aa  263  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0460  glycoside hydrolase family 9  32.47 
 
 		 1017 aa  253  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 1137 aa  248  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  27.25 
 
 		 2042 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  26.96 
 
 		 978 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  53.12 
 
 		 545 aa  95.1  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  56.98 
 
 		 478 aa  92  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  40.3 
 
 		 756 aa  82  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  38.73 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  39.58 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  46.51 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  37.5 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  41.57 
 
 		 446 aa  73.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  52.63 
 
 		 368 aa  72  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  48.42 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  37.5 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  47.06 
 
 		 536 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  41.84 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  44.57 
 
 		 900 aa  67.8  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  31.58 
 
 		 474 aa  67.4  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  43.62 
 
 		 655 aa  67.4  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  36.7 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  37.76 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  43.33 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  34.81 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0324  cellulose-binding family II protein  34.27 
 
 		 694 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  31.39 
 
 		 792 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  37.38 
 
 		 459 aa  63.9  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00790  Endoglucanase E-4 precursor, putative  41.76 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.323744  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  40.2 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  41.18 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  37.63 
 
 		 820 aa  62  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  41.46 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0180  glycoside hydrolase family protein  36.46 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.297284  normal  0.254971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.94 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  41.94 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0901  cellulase  37.23 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  35.29 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 743 aa  61.2  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0179  PHB depolymerase family esterase  36.46 
 
 		 656 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.18087  normal  0.428012 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  24.1 
 
 		 591 aa  60.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2586  Endo-1,4-beta-xylanase  44.55 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  37.37 
 
 		 449 aa  60.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  35.42 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  30.21 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.36 
 
 		 437 aa  60.1  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  37.35 
 
 		 681 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  32.67 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  43.42 
 
 		 829 aa  59.3  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 493 aa  58.9  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  39.18 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  40 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  35.35 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.48 
 
 		 366 aa  58.2  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2441  Endo-1,4-beta-xylanase  36.17 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.637326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  36.84 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  40.7 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  37.89 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  34 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  40.22 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  37.5 
 
 		 974 aa  57.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  38.1 
 
 		 374 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  34.48 
 
 		 593 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  23.39 
 
 		 885 aa  57  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  22.69 
 
 		 833 aa  56.2  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  36.9 
 
 		 479 aa  57  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1307  cellulose-binding family II  39.29 
 
 		 175 aa  56.2  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.530275  hitchhiker  0.00098691 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  32 
 
 		 360 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>