More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4674 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 692 aa  1402    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  41.77 
 
 		 681 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  38.05 
 
 		 700 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 716 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  36.7 
 
 		 714 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  39.85 
 
 		 713 aa  428  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  38.28 
 
 		 733 aa  429  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  39.36 
 
 		 702 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  39.4 
 
 		 715 aa  425  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  38.29 
 
 		 698 aa  426  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 717 aa  422  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1794  TonB-dependent receptor  39.79 
 
 		 664 aa  415  1e-114  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  37.48 
 
 		 706 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  38.08 
 
 		 727 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 742 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 737 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  36.41 
 
 		 736 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 681 aa  363  8e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  35.46 
 
 		 734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  34.98 
 
 		 726 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  34.2 
 
 		 678 aa  333  9e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  30.54 
 
 		 712 aa  253  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43940  TonB-dependent receptor family  31.27 
 
 		 715 aa  249  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.204907  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4581  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 718 aa  241  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 690 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  31.93 
 
 		 690 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  31.88 
 
 		 688 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2318  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2555  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 702 aa  211  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1449  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 740 aa  211  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.389596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 785 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 786 aa  185  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4173  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 739 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 787 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2651  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 800 aa  180  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2688  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 720 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 688 aa  168  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 675 aa  165  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  26.11 
 
 		 797 aa  159  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 774 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 778 aa  147  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 715 aa  144  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 678 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 776 aa  141  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 680 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 770 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 696 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  25.75 
 
 		 721 aa  130  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 791 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  25.75 
 
 		 706 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  25.75 
 
 		 706 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  25.75 
 
 		 706 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  25.75 
 
 		 706 aa  129  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5661  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 769 aa  129  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  25.42 
 
 		 728 aa  125  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.74 
 
 		 701 aa  124  6e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 700 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 700 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 700 aa  120  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1543  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 712 aa  120  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 700 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 700 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 700 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.81 
 
 		 700 aa  119  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.81 
 
 		 700 aa  119  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  22.53 
 
 		 762 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 791 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 700 aa  115  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.54 
 
 		 691 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 705 aa  104  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 705 aa  102  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2309  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  24.22 
 
 		 666 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 682 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 680 aa  98.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 		 703 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 709 aa  97.1  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 697 aa  94  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  21.87 
 
 		 698 aa  90.5  9e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 706 aa  89.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  20.6 
 
 		 735 aa  89  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  25.69 
 
 		 743 aa  89  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.59 
 
 		 703 aa  87.4  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 776 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2786  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.934768  normal  0.0544871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 693 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.76 
 
 		 726 aa  84.7  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  23.07 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  23.93 
 
 		 708 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  20.71 
 
 		 780 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 723 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 701 aa  83.6  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  22.67 
 
 		 717 aa  82.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 723 aa  82.4  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 670 aa  80.5  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.33 
 
 		 702 aa  79.7  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.39 
 
 		 687 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  23.13 
 
 		 708 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  20.26 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>