More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1052 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 280 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  40.91 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.16 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.9 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5812  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0159111 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4628  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000955982  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.23 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.96 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4925  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>