More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6918 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  38.4 
 
 		 1344 aa  687    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 1334 aa  2640    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  36.97 
 
 		 1657 aa  637    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 1265 aa  619  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7125  WD-40 repeat-containing protein  36.45 
 
 		 1401 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.97 
 
 		 1686 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 		 1711 aa  479  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3798  WD40 repeat, subgroup  31.11 
 
 		 1301 aa  455  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  33.7 
 
 		 1357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6781  WD-40 repeat-containing protein  30.76 
 
 		 1230 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.57679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  29.53 
 
 		 1553 aa  437  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 		 1481 aa  432  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 		 1760 aa  425  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1510 aa  427  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  28.65 
 
 		 1236 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  30.52 
 
 		 1733 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0573  transcriptional activator domain-containing protein  31.55 
 
 		 1699 aa  391  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.836093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.19 
 
 		 1240 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  33.31 
 
 		 1355 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.42 
 
 		 1599 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1793  transcriptional regulator, XRE family  35.57 
 
 		 901 aa  366  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.03808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  36.95 
 
 		 919 aa  361  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.86 
 
 		 1583 aa  353  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.5 
 
 		 1609 aa  347  8e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.62 
 
 		 1623 aa  338  5.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.62 
 
 		 1598 aa  337  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.41 
 
 		 1547 aa  337  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.61 
 
 		 1684 aa  321  5e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  29.45 
 
 		 1363 aa  321  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.35 
 
 		 1626 aa  303  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1746  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.18 
 
 		 1256 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.18 
 
 		 1617 aa  292  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.19 
 
 		 1823 aa  287  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1557 aa  285  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  27.79 
 
 		 1211 aa  283  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  29.17 
 
 		 1398 aa  282  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  32.41 
 
 		 1789 aa  281  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  27.82 
 
 		 1163 aa  276  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 1221 aa  276  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.78 
 
 		 1217 aa  275  4.0000000000000004e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  32.88 
 
 		 1196 aa  274  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  32.81 
 
 		 924 aa  272  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1285  WD-40 repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1491 aa  270  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  37.14 
 
 		 696 aa  266  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.49 
 
 		 947 aa  264  8e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3444  WD-40 repeat protein  27.7 
 
 		 1308 aa  259  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  32.92 
 
 		 1364 aa  251  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1399 aa  251  6e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  27.36 
 
 		 1652 aa  249  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  29.95 
 
 		 1190 aa  248  4e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  30.4 
 
 		 1193 aa  242  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  32.55 
 
 		 994 aa  239  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  28.95 
 
 		 1188 aa  234  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  29.22 
 
 		 1831 aa  233  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  29.71 
 
 		 1661 aa  231  5e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.88 
 
 		 1348 aa  231  7e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 		 1161 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  29.49 
 
 		 1161 aa  229  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  29.62 
 
 		 1523 aa  228  6e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1026 aa  227  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6771  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  43.23 
 
 		 737 aa  226  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  28.48 
 
 		 1247 aa  225  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  30.36 
 
 		 1552 aa  223  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1474 aa  223  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  27.3 
 
 		 1176 aa  221  7e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  27.03 
 
 		 1229 aa  220  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0807  Serine/threonine protein kinase-like protein  30.4 
 
 		 1190 aa  219  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.44 
 
 		 1656 aa  219  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  30.83 
 
 		 943 aa  218  7e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1714 aa  216  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5405  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1073 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  26.53 
 
 		 1213 aa  215  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  28.31 
 
 		 1262 aa  214  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2761  WD-40 repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1117 aa  212  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.645221  normal  0.818272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  30.14 
 
 		 1443 aa  212  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.3 
 
 		 1177 aa  212  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  28.94 
 
 		 1367 aa  211  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7111  Serine/threonine protein kinase-like protein  29.1 
 
 		 1194 aa  211  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5886  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.81 
 
 		 865 aa  207  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0610764 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3910  WD-40 repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1152 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1272  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.87 
 
 		 1190 aa  206  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159501 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  24.85 
 
 		 1164 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3773  WD-40 repeat-containing protein  39.82 
 
 		 405 aa  206  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.6 
 
 		 1188 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.15 
 
 		 930 aa  206  4e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2911  transcriptional regulator, SARP family  34.66 
 
 		 885 aa  201  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00504446  hitchhiker  0.0000384659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5302  serine/threonine protein kinase  35.73 
 
 		 972 aa  199  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1869  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  44.31 
 
 		 716 aa  198  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0650147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  30.06 
 
 		 1901 aa  197  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 		 1807 aa  197  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3207  WD-40 repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1157 aa  196  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.357908 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  26.63 
 
 		 1411 aa  195  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0727  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.96 
 
 		 833 aa  193  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.851559  normal  0.037092 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  23.82 
 
 		 1016 aa  193  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  22.12 
 
 		 1858 aa  193  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  26.58 
 
 		 1209 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  23.82 
 
 		 1016 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.02 
 
 		 1868 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4807  serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 1078 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.551353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  32.81 
 
 		 1599 aa  188  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>