104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2141 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 159 aa  327  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  55.83 
 
 		 166 aa  191  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.36 
 
 		 170 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  46.75 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  46.75 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  46.1 
 
 		 165 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  46.1 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  48.48 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.45 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.11 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  30.38 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  37 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.61 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.91 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.92 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  31.73 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  35.53 
 
 		 355 aa  55.1  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.01 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  33 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.35 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  30.93 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  38.55 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.65 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.72 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 389 aa  48.1  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  30.84 
 
 		 138 aa  47.8  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 181 aa  47.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.14 
 
 		 179 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  38.46 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0138  cupin 2 protein  38.24 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.7 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0971  cupin domain-containing protein  40.68 
 
 		 171 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.341283  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.47 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4101  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.170919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  35.06 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4566  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 175 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464338  hitchhiker  0.000237614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1033  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 		 172 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.714129  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3660  cupin 2, barrel  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276566  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4707  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324848  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5593  cupin 2 domain-containing protein  28.79 
 
 		 175 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0614455 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 146 aa  44.7  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  35.21 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.91 
 
 		 149 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1334  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  35 
 
 		 129 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2496  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1107  hypothetical protein  29.32 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.049501  normal  0.353862 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1499  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0819  cupin 2, barrel  41.18 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.105884  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0317  hypothetical protein  30.23 
 
 		 177 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.453914  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0593  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.133951  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1309  cupin domain-containing protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.3623  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1236  cupin domain-containing protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0974  hypothetical protein  30.23 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3608  cupin 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3986  cupin 2 domain-containing protein  29.32 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0531133  normal  0.0462942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.38 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2699  hypothetical protein  28.4 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.615203  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0177  cupin domain-containing protein  29.46 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4235  cupin 2 domain-containing protein  29.46 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7061  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.46 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.985846 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.61 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 377 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4508  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.77 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4640  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.77 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.650295  normal  0.123647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.03 
 
 		 153 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  34.12 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  23.48 
 
 		 145 aa  41.6  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.43 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3018  cupin domain-containing protein  28.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.117139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2775  cupin 2 domain-containing protein  28.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.108544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2982  polyketide synthesis domain protein  28.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2260  polyketide synthesis domain protein  28.36 
 
 		 120 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0666056 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2770  cupin domain-containing protein  28.36 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2719  hypothetical protein  28.36 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2981  cupin domain-containing protein  28.36 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2978  polyketide synthesis domain protein  28.36 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000628046 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2600  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.556264 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4829  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 182 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0191257  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 126 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>