115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0892 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 330 aa  667    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  32.24 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  29.97 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 359 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  29.32 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  28.38 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  28.96 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  27.87 
 
 		 456 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  28.14 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  29.04 
 
 		 448 aa  106  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  32.08 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  26.57 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  30.88 
 
 		 470 aa  99.4  7e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  31.31 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3084  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  24.4 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  31.9 
 
 		 348 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 516 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  27.86 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  24.14 
 
 		 402 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  24.04 
 
 		 513 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  24.65 
 
 		 564 aa  92.8  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  26.69 
 
 		 373 aa  92  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.95 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  22.97 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 355 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  24.7 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  24.7 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  28.97 
 
 		 355 aa  89.4  9e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.38 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  24.23 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  26.8 
 
 		 542 aa  87.4  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  24.47 
 
 		 353 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  31.12 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  24.33 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  23.03 
 
 		 354 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  23.03 
 
 		 354 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  23.53 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  22.34 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  23.03 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  24.02 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  23.89 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  22.41 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  28.22 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2043  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.95 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.259973  normal  0.118858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  27.72 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  24.41 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.46 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  24.07 
 
 		 310 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  24.3 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  25.63 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0064  phytoene/squalene synthetase  28.93 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  43.06 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 292 aa  53.5  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  28.48 
 
 		 310 aa  52.8  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3828  Phytoene synthase  21.54 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.597595  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  22.26 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  24.06 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  25.94 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  25.94 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2069  Squalene/phytoene synthase  27.42 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.910011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1601  Squalene/phytoene synthase  23.04 
 
 		 575 aa  50.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0484297  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  24.64 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  28.12 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  25 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  23.77 
 
 		 303 aa  48.5  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  24.75 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  32.12 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  25.18 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  42.65 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  24 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  28.71 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1814  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  23.95 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1047  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.81 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.477192  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  28.71 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  23.81 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  41.94 
 
 		 289 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  29.14 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3076  phytoene synthase  21.67 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.270581  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  21.5 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3132  squalene/phytoene synthase  20.92 
 
 		 327 aa  46.2  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.901985 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  25.94 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  25.51 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  28.45 
 
 		 277 aa  46.2  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  27.59 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  26.02 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3578  squalene/phytoene synthase  36.23 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0270096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  26.53 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  28.3 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  24.64 
 
 		 310 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  24.4 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  25.89 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.64 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2501  Phytoene synthase  21.55 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000012826  normal  0.0149177 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0378  Phytoene synthase  35.21 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.883354  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>