277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4554 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4554  squalene synthase HpnD  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.124742  normal  0.209496 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5178  squalene/phytoene synthase  98.94 
 
 		 286 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5681  squalene/phytoene synthase  98.94 
 
 		 344 aa  554  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450879  hitchhiker  0.0020025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0017  squalene/phytoene synthase  96.81 
 
 		 282 aa  544  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3173  squalene synthase HpnD  95.04 
 
 		 282 aa  534  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170379  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5506  squalene synthase HpnD  95.04 
 
 		 282 aa  534  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0194601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4953  squalene/phytoene synthase  95.04 
 
 		 282 aa  536  1e-151  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  normal  0.0913001 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3277  squalene/phytoene synthase family protein  83.33 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.173331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3163  squalene/phytoene synthase family protein  83.33 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.395921  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2102  putative phytoene synthase  83.33 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1411  putative phytoene synthase  83.33 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590662  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1131  putative phytoene synthase  83.33 
 
 		 282 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0886071  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2361  phytoene synthase, putative  81.56 
 
 		 397 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1491  squalene/phytoene synthase  83.27 
 
 		 275 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  75.53 
 
 		 282 aa  422  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  74.47 
 
 		 306 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4139  squalene synthase HpnD  76.24 
 
 		 290 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  63.77 
 
 		 279 aa  328  7e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  61.37 
 
 		 279 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  62.64 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2271  squalene/phytoene synthase  56.68 
 
 		 278 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.3606  normal  0.152656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2684  squalene/phytoene synthase  60.23 
 
 		 278 aa  310  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  58.36 
 
 		 279 aa  308  5.9999999999999995e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1718  squalene/phytoene synthase  57.71 
 
 		 279 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.150887  normal  0.105129 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4149  phytoene synthase  56.6 
 
 		 282 aa  298  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.165993  normal  0.461254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  56.78 
 
 		 294 aa  297  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  52.65 
 
 		 283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  55.89 
 
 		 283 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  53 
 
 		 283 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  52.28 
 
 		 283 aa  279  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  52.65 
 
 		 283 aa  278  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  56.11 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3154  squalene synthase HpnD  56.09 
 
 		 285 aa  276  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4953  squalene/phytoene synthase  57.09 
 
 		 301 aa  275  5e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.251638  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0118  squalene/phytoene synthase  50.78 
 
 		 290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1827  squalene synthase HpnD  45.99 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  43.84 
 
 		 687 aa  195  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  36.8 
 
 		 285 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  36.55 
 
 		 278 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  35.61 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  35.02 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  36.54 
 
 		 277 aa  136  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  34.43 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  32.48 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  32.73 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.32 
 
 		 281 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  32.82 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  34.16 
 
 		 279 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  34.46 
 
 		 279 aa  120  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  34.08 
 
 		 279 aa  119  7e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  30.34 
 
 		 293 aa  115  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  30.71 
 
 		 280 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  29.75 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  33.19 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  37.84 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  33.6 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  32.6 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23110  squalene synthase HpnD  35.32 
 
 		 288 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.246209  normal  0.237195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  32.41 
 
 		 302 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  30.45 
 
 		 310 aa  102  9e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  29.51 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2842  squalene/phytoene synthase  31.97 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5716  squalene/phytoene synthase  33.07 
 
 		 300 aa  99  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.038374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  28.69 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.85 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  34.93 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.43 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  28.92 
 
 		 311 aa  95.9  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3404  Phytoene synthase  34.44 
 
 		 276 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  0.128424 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  30.94 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  30.32 
 
 		 316 aa  94  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.51 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  37.57 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  30.83 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3509  phytoene synthase  34.2 
 
 		 361 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  34.68 
 
 		 286 aa  92.4  7e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  33.61 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  30.59 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  26.87 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4441  squalene/phytoene synthase  35.91 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  35.18 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0820  squalene/phytoene synthase  35.68 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.122884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  32.35 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2244  Phytoene synthase  27.37 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0494  phytoene synthase  33.97 
 
 		 342 aa  88.2  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  31.42 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  29.15 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0142  phytoene synthase  32.44 
 
 		 337 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  28.94 
 
 		 310 aa  87.4  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2212  Phytoene synthase  32.24 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.306787  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  29.95 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  37.7 
 
 		 337 aa  86.7  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4931  squalene/phytoene synthase  35.36 
 
 		 303 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.974749  normal  0.56653 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  30.32 
 
 		 325 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1486  Phytoene synthase  34.08 
 
 		 280 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000477032 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  31 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  27.98 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  30 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  37.14 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  28.81 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>