More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1324 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  100 
 
 
845 aa  1698  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  48.61 
 
 
856 aa  719  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  63.08 
 
 
839 aa  1035  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  99.64 
 
 
844 aa  1630  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  65.07 
 
 
834 aa  1081  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  51.5 
 
 
853 aa  792  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  91.01 
 
 
844 aa  1532  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.47 
 
 
849 aa  1052  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  61.55 
 
 
844 aa  998  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  47.95 
 
 
856 aa  737  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  42.59 
 
 
843 aa  651  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  62.8 
 
 
848 aa  1053  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.23 
 
 
846 aa  567  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  39.83 
 
 
846 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1174  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.1 
 
 
858 aa  504  1e-141  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149804  normal  0.102864 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  49.06 
 
 
535 aa  505  1e-141  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  50.87 
 
 
535 aa  499  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  49.62 
 
 
533 aa  498  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  48.68 
 
 
532 aa  485  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  50 
 
 
533 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  49.52 
 
 
534 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2336  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.15 
 
 
759 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.217617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0887  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.15 
 
 
785 aa  482  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  48.47 
 
 
533 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0891  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.15 
 
 
785 aa  482  1e-134  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.983907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  48.87 
 
 
533 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  48.49 
 
 
533 aa  476  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  46.34 
 
 
532 aa  471  1e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  47.45 
 
 
531 aa  468  1e-130  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  47.76 
 
 
534 aa  458  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  48.32 
 
 
534 aa  459  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  46.78 
 
 
533 aa  447  1e-124  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  46.3 
 
 
532 aa  442  1e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  46.3 
 
 
532 aa  442  1e-122  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  46.8 
 
 
534 aa  442  1e-122  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  43.27 
 
 
554 aa  419  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  42.78 
 
 
556 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  43.35 
 
 
554 aa  410  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  47.02 
 
 
554 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  43.61 
 
 
535 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.71 
 
 
554 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  44.2 
 
 
554 aa  402  1e-110  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1239  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.88 
 
 
762 aa  402  1e-110  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.194675  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  41.32 
 
 
532 aa  400  1e-110  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  44.2 
 
 
554 aa  402  1e-110  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  42.09 
 
 
537 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3221  protein-export membrane protein SecD  36.21 
 
 
761 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.390214  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  42.35 
 
 
525 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  41.76 
 
 
531 aa  396  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  40.29 
 
 
530 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  34.53 
 
 
759 aa  383  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  1.07208e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3618  protein-export membrane protein SecD  33.24 
 
 
735 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.14723e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  33.81 
 
 
849 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 
533 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0092  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.75 
 
 
995 aa  376  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  35.11 
 
 
740 aa  375  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  6.74169e-05 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  41.44 
 
 
533 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.56259e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  40.48 
 
 
533 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8810  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.39 
 
 
756 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  40.83 
 
 
532 aa  369  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  41.71 
 
 
532 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1629  protein-export membrane protein SecD  35.43 
 
 
748 aa  363  7e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.683752  normal  0.475056 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  41.95 
 
 
530 aa  363  1e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  40.73 
 
 
551 aa  361  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  42.24 
 
 
526 aa  360  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  39.67 
 
 
530 aa  357  4e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  33.92 
 
 
1055 aa  356  9e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  41.3 
 
 
533 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  41.65 
 
 
632 aa  356  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 
632 aa  355  1e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  40.8 
 
 
632 aa  355  3e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  41.14 
 
 
594 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  41.14 
 
 
594 aa  352  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  39.93 
 
 
533 aa  351  3e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  41.11 
 
 
532 aa  351  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  40.34 
 
 
532 aa  351  3e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 
508 aa  351  4e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 
531 aa  349  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  38.8 
 
 
505 aa  349  1e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  42.22 
 
 
533 aa  348  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  37 
 
 
534 aa  344  3e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.81 
 
 
981 aa  345  3e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  40.67 
 
 
524 aa  343  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  3.11445e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2178  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.52 
 
 
995 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.900836  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  37.95 
 
 
501 aa  341  3e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.7 
 
 
625 aa  340  6e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  35.03 
 
 
1029 aa  337  7e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2513  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.02 
 
 
750 aa  336  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000183584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0113  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.24 
 
 
991 aa  335  2e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.758548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  40.15 
 
 
640 aa  334  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  39.81 
 
 
681 aa  334  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  34.94 
 
 
990 aa  333  1e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.12 
 
 
996 aa  332  2e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  40.08 
 
 
636 aa  331  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3409  preprotein translocase subunit SecD  41.35 
 
 
621 aa  330  6e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768129  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  38.09 
 
 
626 aa  327  6e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  39.61 
 
 
621 aa  326  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  39.36 
 
 
633 aa  326  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  41.68 
 
 
604 aa  325  2e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  37.15 
 
 
526 aa  325  2e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>