More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4342 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1406 aa  2871    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  39 
 
 		 725 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  33.62 
 
 		 1764 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 		 697 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  39.65 
 
 		 648 aa  377  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  38.38 
 
 		 695 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  37.08 
 
 		 700 aa  367  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  41.7 
 
 		 530 aa  350  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.17 
 
 		 530 aa  337  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  33.08 
 
 		 656 aa  303  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  34.03 
 
 		 652 aa  300  1e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  30.83 
 
 		 669 aa  286  2.0000000000000002e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  32.71 
 
 		 673 aa  284  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  36.88 
 
 		 542 aa  283  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  38.61 
 
 		 663 aa  279  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  34.24 
 
 		 542 aa  269  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  34.46 
 
 		 634 aa  266  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  34.69 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 685 aa  256  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  32.92 
 
 		 720 aa  256  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  32.36 
 
 		 717 aa  256  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 573 aa  253  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  30.2 
 
 		 637 aa  250  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  34.91 
 
 		 604 aa  248  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  31.83 
 
 		 677 aa  247  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  29.46 
 
 		 762 aa  244  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  37.05 
 
 		 536 aa  244  1e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  29.46 
 
 		 762 aa  244  1e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  32.26 
 
 		 532 aa  242  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  32.12 
 
 		 527 aa  234  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  34.44 
 
 		 889 aa  225  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  39.61 
 
 		 322 aa  218  8e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  34.88 
 
 		 899 aa  217  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  31.32 
 
 		 525 aa  215  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  31.38 
 
 		 548 aa  208  5e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.81 
 
 		 549 aa  194  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.87 
 
 		 594 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  32.13 
 
 		 878 aa  186  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  28.63 
 
 		 533 aa  183  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.01 
 
 		 810 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  25.53 
 
 		 614 aa  178  7e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  28.68 
 
 		 531 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 713 aa  174  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  27.25 
 
 		 529 aa  170  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  34.32 
 
 		 670 aa  169  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  28.6 
 
 		 742 aa  169  2.9999999999999998e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  27.71 
 
 		 514 aa  166  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  30.53 
 
 		 524 aa  163  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.45 
 
 		 632 aa  164  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 1094 aa  159  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  28.75 
 
 		 625 aa  158  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  26.25 
 
 		 546 aa  158  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  33.44 
 
 		 488 aa  157  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 4489 aa  152  5e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 681 aa  152  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 909 aa  150  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.8 
 
 		 725 aa  149  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 1694 aa  149  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  28.77 
 
 		 733 aa  147  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.53 
 
 		 818 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  34.7 
 
 		 718 aa  147  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.84 
 
 		 784 aa  147  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1676 aa  146  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.97 
 
 		 1022 aa  146  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  26.26 
 
 		 636 aa  146  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.33 
 
 		 1056 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.69 
 
 		 887 aa  145  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  30.02 
 
 		 624 aa  145  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.97 
 
 		 816 aa  145  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 543 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  26.15 
 
 		 482 aa  144  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  35.43 
 
 		 875 aa  144  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 3035 aa  144  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  24.24 
 
 		 484 aa  143  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 502 aa  141  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  28.18 
 
 		 519 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  33.82 
 
 		 764 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  33.57 
 
 		 622 aa  140  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  25.93 
 
 		 795 aa  140  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 		 988 aa  140  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 637 aa  139  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 494 aa  139  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 3145 aa  138  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 626 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 1276 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 		 1154 aa  136  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 362 aa  135  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 538 aa  135  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.72 
 
 		 689 aa  135  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.95 
 
 		 626 aa  135  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 614 aa  135  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.87 
 
 		 714 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 927 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  31.75 
 
 		 732 aa  133  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 808 aa  133  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 955 aa  133  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  32.53 
 
 		 714 aa  132  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.66 
 
 		 626 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.66 
 
 		 614 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.66 
 
 		 614 aa  132  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>