More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3077 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  75.33 
 
 		 516 aa  742    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  74.1 
 
 		 523 aa  733    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  100 
 
 		 527 aa  1035    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  78.24 
 
 		 528 aa  785    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  82.04 
 
 		 528 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  79.81 
 
 		 526 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  78.75 
 
 		 523 aa  803    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  58.61 
 
 		 520 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  60.13 
 
 		 525 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  53.53 
 
 		 529 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  57.79 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  58.08 
 
 		 502 aa  481  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  53.83 
 
 		 537 aa  473  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  53.53 
 
 		 524 aa  464  1e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  55 
 
 		 501 aa  451  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  55.15 
 
 		 508 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  54.15 
 
 		 503 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  53.93 
 
 		 503 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  53.08 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  53.08 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  53.68 
 
 		 496 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  54 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  51.55 
 
 		 520 aa  438  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  53.68 
 
 		 496 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  47.9 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  47.44 
 
 		 527 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  50.11 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  47.83 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  48.31 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  47.97 
 
 		 505 aa  387  1e-106  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  45.69 
 
 		 506 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.36 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.16 
 
 		 483 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  49.28 
 
 		 509 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  44.21 
 
 		 483 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  43.3 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  44.16 
 
 		 487 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.73 
 
 		 535 aa  351  2e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  43.27 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.33 
 
 		 506 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.33 
 
 		 493 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  41.25 
 
 		 493 aa  349  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  44.35 
 
 		 514 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  41.48 
 
 		 508 aa  339  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  43.76 
 
 		 528 aa  336  7.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  43.17 
 
 		 498 aa  334  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  42.42 
 
 		 501 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  40.44 
 
 		 588 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  42.77 
 
 		 497 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  42.13 
 
 		 496 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  39.88 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.84 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  48.11 
 
 		 524 aa  326  8.000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  40.95 
 
 		 518 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.38 
 
 		 498 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.13 
 
 		 511 aa  324  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  41.34 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.89 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  39.85 
 
 		 499 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.97 
 
 		 524 aa  322  9.000000000000001e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.77 
 
 		 524 aa  322  9.999999999999999e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2022  protease Do  41.67 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.303504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  45.93 
 
 		 501 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.67 
 
 		 498 aa  317  5e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  40.68 
 
 		 523 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  42.37 
 
 		 497 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  40.67 
 
 		 508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  40 
 
 		 515 aa  314  1.9999999999999998e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  42.95 
 
 		 511 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  42.89 
 
 		 511 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.04 
 
 		 464 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.45 
 
 		 476 aa  312  9e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.2 
 
 		 501 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  38.96 
 
 		 457 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  41.4 
 
 		 500 aa  310  4e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42 
 
 		 462 aa  310  5e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  42.92 
 
 		 476 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  41.1 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  42.8 
 
 		 516 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.04 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.21 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.72 
 
 		 473 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  40.75 
 
 		 524 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.78 
 
 		 474 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  41.02 
 
 		 478 aa  303  6.000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.78 
 
 		 482 aa  302  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.72 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  37.48 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  42.64 
 
 		 505 aa  300  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  34.95 
 
 		 497 aa  299  7e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  40.22 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.48 
 
 		 481 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  42.08 
 
 		 477 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  39.16 
 
 		 458 aa  298  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  42.67 
 
 		 485 aa  298  2e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  41.6 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.56 
 
 		 492 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  39.78 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  39.78 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  39.78 
 
 		 483 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>