120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9531 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  100 
 
 		 1137 aa  2291    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  29.33 
 
 		 1190 aa  360  9e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  27.64 
 
 		 1175 aa  296  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  26.68 
 
 		 1212 aa  293  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  23.1 
 
 		 797 aa  103  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.69 
 
 		 1620 aa  99.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  22.98 
 
 		 585 aa  95.9  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  24.6 
 
 		 636 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  22.86 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  26.81 
 
 		 941 aa  83.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  25 
 
 		 632 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.48 
 
 		 1189 aa  81.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  22.48 
 
 		 1099 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  32.84 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  25.96 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1018 aa  76.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  26.71 
 
 		 1126 aa  75.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  32.24 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  32.24 
 
 		 553 aa  75.5  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  25.56 
 
 		 754 aa  75.5  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.9 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  30.23 
 
 		 795 aa  73.2  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  24.08 
 
 		 1284 aa  73.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  30.39 
 
 		 479 aa  73.2  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.52 
 
 		 622 aa  71.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  28.27 
 
 		 1651 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  25.87 
 
 		 1585 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  27.6 
 
 		 633 aa  70.9  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  25.87 
 
 		 1585 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  24.33 
 
 		 622 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  22.22 
 
 		 1048 aa  69.7  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  33.06 
 
 		 611 aa  69.3  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  23.56 
 
 		 1653 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  31.86 
 
 		 1139 aa  68.6  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  29.49 
 
 		 1153 aa  68.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  29.05 
 
 		 2245 aa  67.4  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  24.32 
 
 		 629 aa  67.8  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1126 aa  66.6  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  23.22 
 
 		 986 aa  67  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  23.93 
 
 		 619 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  26.04 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.27 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  28.87 
 
 		 1090 aa  65.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  30.41 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  30.85 
 
 		 651 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  23.39 
 
 		 1185 aa  63.9  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  21.4 
 
 		 1271 aa  63.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  33.33 
 
 		 716 aa  62.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  26.22 
 
 		 1118 aa  62.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3969  RecB family-like nuclease  30.2 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4043  RecB family-like nuclease  30.2 
 
 		 1143 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  28.72 
 
 		 1999 aa  60.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  29.21 
 
 		 715 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.32 
 
 		 1077 aa  59.7  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  25.22 
 
 		 952 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  31.88 
 
 		 1097 aa  59.7  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  22.94 
 
 		 906 aa  59.3  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3983  RecB family-like nuclease  28.71 
 
 		 1143 aa  59.3  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0895851 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3239  RecB family nuclease, putative  29.08 
 
 		 1228 aa  59.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.262679 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.33 
 
 		 633 aa  58.9  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  22 
 
 		 655 aa  58.5  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  26.07 
 
 		 237 aa  58.9  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2223  RecB family-like nuclease  29.41 
 
 		 1163 aa  58.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  25.78 
 
 		 633 aa  58.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  24.83 
 
 		 633 aa  58.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  26.57 
 
 		 1108 aa  58.2  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2182  RecB family nuclease, putative  27.91 
 
 		 1198 aa  58.2  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000250648  decreased coverage  0.00000209405 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  29.15 
 
 		 752 aa  57.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  23.02 
 
 		 686 aa  57.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0634  superfamily I DNA/RNA helicase  27.65 
 
 		 1584 aa  57  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  25.25 
 
 		 650 aa  55.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.31 
 
 		 606 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  28.57 
 
 		 1280 aa  55.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.17 
 
 		 1151 aa  55.1  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  31.67 
 
 		 2310 aa  55.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.46 
 
 		 1196 aa  55.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1116 aa  54.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.21 
 
 		 315 aa  53.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  27.32 
 
 		 1247 aa  53.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  25.25 
 
 		 650 aa  53.1  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  25.98 
 
 		 1408 aa  53.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  27.48 
 
 		 1250 aa  52.8  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1275 aa  52.8  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1172 aa  52.4  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  27.5 
 
 		 1082 aa  52  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  25.77 
 
 		 643 aa  51.6  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.53 
 
 		 908 aa  51.6  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2931  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.41 
 
 		 254 aa  50.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  24.77 
 
 		 946 aa  50.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.46 
 
 		 1324 aa  50.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  26.45 
 
 		 914 aa  49.7  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  22.22 
 
 		 934 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.03 
 
 		 932 aa  48.9  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  30.99 
 
 		 268 aa  48.5  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1215 aa  48.9  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1062 aa  48.9  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  23.79 
 
 		 916 aa  48.5  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1350 aa  48.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  21.97 
 
 		 928 aa  47.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1080  AAA ATPase  28.97 
 
 		 1136 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>