More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4382 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4382  secretion protein HlyD  100 
 
 
515 aa  1035    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.807644  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0729  secretion protein HlyD family protein  63.88 
 
 
508 aa  668    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0411  secretion protein HlyD family protein  50.11 
 
 
504 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3423  secretion protein HlyD family protein  48.21 
 
 
509 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678336  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2681  secretion protein HlyD family protein  48.21 
 
 
509 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0224  secretion protein HlyD  40.27 
 
 
627 aa  428  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3265  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2856  secretion protein HlyD family protein  29.53 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0279875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3518  secretion protein HlyD family protein  32.51 
 
 
550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0473  secretion protein HylD  29.27 
 
 
457 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150139  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4000  secretion protein HlyD family protein  28.17 
 
 
457 aa  157  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3836  secretion protein HlyD family protein  25.81 
 
 
457 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.395614  normal  0.929001 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0927  secretion protein HlyD  26.99 
 
 
460 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0303688  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2692  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.78 
 
 
465 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2315  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  26.78 
 
 
465 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.321229  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06454  hypothetical protein  25.15 
 
 
457 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4164  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.95 
 
 
469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.833076  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0076  secretion protein HlyD family protein  25.15 
 
 
506 aa  122  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.247025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2714  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  27.12 
 
 
451 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.401669  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0983  secretion protein HlyD family protein  25.54 
 
 
439 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.213399  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5105  secretion protein HlyD family protein  23.55 
 
 
498 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4148  HlyD family secretion protein  23.57 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2557  secretion protein HlyD  23.91 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1904  hemolysin secretion protein-like  21.66 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.466134  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0511  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.73 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0235  secretion protein HlyD  26.76 
 
 
500 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2429  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.81 
 
 
441 aa  110  6e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2759  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.1 
 
 
421 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246245  normal  0.864922 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0623  secretion protein HlyD  32.14 
 
 
360 aa  110  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2575  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24 
 
 
480 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00303774 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0164  type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.05 
 
 
487 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.846875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4926  HlyD family secretion protein  25.16 
 
 
472 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1101  secretion protein, HlyD family  23.4 
 
 
463 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1969  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.63 
 
 
468 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.786777  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2399  secretion protein HlyD  25.59 
 
 
467 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.105564  hitchhiker  0.0000263844 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1445  putative membrane-fusion protein  24.57 
 
 
434 aa  107  6e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00910386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2137  type I secretion adaptor protein (HlyD family)  23.33 
 
 
442 aa  106  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.83885  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0892  acriflavine resistance protein  22.13 
 
 
488 aa  104  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00239109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3075  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.16 
 
 
473 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.775261  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5004  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.16 
 
 
447 aa  103  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.278791  normal  0.604975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6669  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.11 
 
 
466 aa  103  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00836718  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1836  secretion protein HlyD family protein  22.22 
 
 
522 aa  103  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.161085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0621  secretion protein HlyD  33.71 
 
 
710 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749458  normal  0.582939 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1957  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  23.21 
 
 
511 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0042  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.88 
 
 
442 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2437  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.13 
 
 
428 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0162  HlyD family secretion protein  23.63 
 
 
481 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0547  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.32 
 
 
439 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0383  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.34 
 
 
468 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.172462  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02941  HlyD family secretion protein  23.49 
 
 
455 aa  100  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.107369  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1212  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.57 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1057  RTX toxin transporter  25.8 
 
 
467 aa  99  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3063  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.78 
 
 
453 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6406  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  25.11 
 
 
480 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2823  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.98 
 
 
443 aa  98.2  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.51941 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0794  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  27.23 
 
 
440 aa  97.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00028021  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3047  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  24.02 
 
 
477 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.666099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3819  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.37 
 
 
514 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0891918  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0544  secretion protein HlyD family protein  22.32 
 
 
576 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.212185  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0527  secretion protein HlyD family protein  22.32 
 
 
576 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6210  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  24.89 
 
 
480 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.596847  normal  0.481561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2661  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.8 
 
 
473 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0206  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.89 
 
 
430 aa  94  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1083  bacteriocin ABC transporter, bacteriocin-binding protein, putative  21.5 
 
 
500 aa  94  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.102695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1842  secretion protein HlyD family protein  29.86 
 
 
330 aa  93.2  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0372122  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2301  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.18 
 
 
468 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0020  leukotoxin secretion protein D  22.53 
 
 
479 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0218  leukotoxin secretion protein  22.68 
 
 
396 aa  92.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0382  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.46 
 
 
460 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3811  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  24.01 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00739118 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1882  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.91 
 
 
430 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2059  HlyD family secretion protein  24.95 
 
 
469 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3201  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.6 
 
 
471 aa  91.3  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.195077  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2195  HlyD family secretion protein  24.95 
 
 
471 aa  91.3  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2016  type I secretion membrane fusion protein, HlyD family  22.57 
 
 
480 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.337577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3769  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.84 
 
 
471 aa  90.5  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6771  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.71 
 
 
475 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2093  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.86 
 
 
468 aa  90.1  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0366  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.57 
 
 
460 aa  90.1  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1515  HlyD family secretion protein  32.24 
 
 
227 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.619726 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1191  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  22.81 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.795272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1658  secretion protein HlyD family protein  29.19 
 
 
330 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1003  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.91 
 
 
439 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001011  ABC-type protease exporter membrane fusion protein (MFP) family component PrtE/AprE  22.06 
 
 
463 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2552  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.31 
 
 
472 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0118  hemolysin secretion protein-like  22.91 
 
 
417 aa  89.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  decreased coverage  0.00640851  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3260  HlyD family secretion protein  23.73 
 
 
460 aa  89  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.500771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1419  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.38 
 
 
446 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1802  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  23.11 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.520041 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6075  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.54 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0374496  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2526  leukotoxin secretion protein  22.56 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1132  hypothetical protein  28.11 
 
 
567 aa  87.8  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.107849  normal  0.642224 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0301  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  23.09 
 
 
471 aa  87.8  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6372  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.54 
 
 
474 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17068  normal  0.732434 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1509  secretion system protein D  21.44 
 
 
378 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5063  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  20.9 
 
 
458 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.555972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0475  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  22.91 
 
 
460 aa  87.4  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.205035  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1598  hlyD family secretion protein  24.73 
 
 
389 aa  87  7e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0549137  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5972  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  20.38 
 
 
433 aa  87  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.802564  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0883  HlyD family type I secretion membrane fusion protein  21.3 
 
 
491 aa  86.7  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>