More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2185 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 465 aa  959    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  52.13 
 
 		 461 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  51.71 
 
 		 446 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  50.57 
 
 		 451 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  49.33 
 
 		 452 aa  457  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  48.97 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  48.98 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  47.98 
 
 		 466 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  47.88 
 
 		 450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  48.29 
 
 		 477 aa  441  1e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  47.65 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  47.1 
 
 		 460 aa  431  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  45.84 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  46.69 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  46.69 
 
 		 422 aa  347  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  39.68 
 
 		 458 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  40.87 
 
 		 460 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  38.86 
 
 		 460 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 		 465 aa  334  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 		 482 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 482 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  41.64 
 
 		 481 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  39.42 
 
 		 482 aa  301  2e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 482 aa  294  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  38.43 
 
 		 362 aa  206  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  36.1 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  32.86 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  34.66 
 
 		 387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  32 
 
 		 371 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  26.87 
 
 		 410 aa  150  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 330 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  30.45 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 418 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  28.32 
 
 		 335 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 325 aa  97.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  30.8 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  26.81 
 
 		 479 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 319 aa  94  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 330 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 349 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1580  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 429 aa  89  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  32.14 
 
 		 363 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 327 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 330 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  27.99 
 
 		 330 aa  87  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 496 aa  86.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  28.37 
 
 		 346 aa  85.5  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  26.56 
 
 		 510 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  28.03 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0937  radical SAM superfamily protein  23.64 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.6279  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 380 aa  83.2  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 332 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  28.84 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.89 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0566  radical SAM family protein  28.41 
 
 		 332 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 		 359 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  26.26 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  27.18 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  26.32 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.78 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 399 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 427 aa  79  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 414 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  26.61 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 1005 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  25.76 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 356 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  25.87 
 
 		 387 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4936  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5768  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.6 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.922128  normal  0.949586 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.33 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.24 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26.8 
 
 		 370 aa  73.9  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.38 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  24.04 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 359 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.43 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>