126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1577 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 336 aa  666    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  35.78 
 
 		 346 aa  210  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  38.46 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  31.45 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  34.46 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  34.33 
 
 		 324 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  30.94 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  29.62 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  31.48 
 
 		 337 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  26.17 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  29.81 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  28.13 
 
 		 336 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  32.26 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  28.96 
 
 		 336 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  28.96 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  28.96 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  28.96 
 
 		 336 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  28.66 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  28.96 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  27.74 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  28.35 
 
 		 336 aa  123  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  31.09 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  31.19 
 
 		 315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  27.55 
 
 		 344 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  31.41 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  29.81 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  28.39 
 
 		 332 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  30.43 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  26.84 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  26.59 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  30.28 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 337 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  23.2 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.87 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  23.68 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  28.76 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  25.45 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  22.89 
 
 		 335 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  26.5 
 
 		 339 aa  94.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  25.37 
 
 		 343 aa  89.4  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  25.6 
 
 		 374 aa  87.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  25.48 
 
 		 336 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  25.72 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  26.67 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  24.71 
 
 		 334 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.88 
 
 		 306 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  22.94 
 
 		 341 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  21.94 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  27.3 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  22.05 
 
 		 333 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  21.82 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  20.79 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  20.79 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  26.12 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  21.85 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.71 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  25.96 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  27.07 
 
 		 331 aa  69.7  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0047  DNA polymerase III delta subunit-related protein  25.62 
 
 		 399 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00913059  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0787  DNA polymerase III subunit delta  25.56 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.186067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  25.74 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  22.29 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  23.85 
 
 		 341 aa  67  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  24.6 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  25.08 
 
 		 327 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  27.96 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2015  DNA polymerase III subunit delta  21.54 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2300  DNA polymerase III subunit delta  21.54 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0478534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  25.33 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  23.1 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0260  DNA polymerase III, delta subunit  27.27 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.389974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  24.54 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  24.46 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  20.83 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  23.17 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  23.31 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.18 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0093  DNA polymerase III subunit delta  28.1 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  24.17 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  27.55 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0169  DNA polymerase III subunit delta  27.62 
 
 		 342 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00831  DNA polymerase III subunit delta  25.93 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0698432 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  24.27 
 
 		 346 aa  52  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0745  DNA polymerase III, delta subunit  28.62 
 
 		 312 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.1 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0286  DNA polymerase III subunit delta  24.91 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0100  DNA polymerase III subunit delta  28.14 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  25.91 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3469  DNA polymerase III subunit delta  24.23 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0434  DNA polymerase III subunit delta  26.67 
 
 		 342 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1397  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  21.48 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.610857  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0625  DNA polymerase III subunit delta  25.78 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  29.27 
 
 		 641 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  27.38 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  25.58 
 
 		 458 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>