More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1094 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_1117  DNA ligase, NAD-dependent  50.45 
 
 		 673 aa  635    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.62969  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 677 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  52.99 
 
 		 670 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.84 
 
 		 670 aa  735    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 665 aa  678    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  53.85 
 
 		 673 aa  681    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  62.89 
 
 		 672 aa  840    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.05 
 
 		 669 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  52.17 
 
 		 675 aa  662    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  50.3 
 
 		 673 aa  649    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.2 
 
 		 669 aa  718    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  52.25 
 
 		 668 aa  669    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  718    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  718    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  47.68 
 
 		 678 aa  647    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  718    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  55.59 
 
 		 670 aa  739    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 680 aa  641    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1715  DNA ligase, NAD-dependent  51.85 
 
 		 682 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000203227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  51.11 
 
 		 683 aa  644    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.29 
 
 		 669 aa  719    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  54.85 
 
 		 659 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  51.25 
 
 		 711 aa  661    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  50 
 
 		 670 aa  644    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  56.24 
 
 		 670 aa  754    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  49.78 
 
 		 680 aa  653    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  51.12 
 
 		 676 aa  672    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  48 
 
 		 674 aa  635    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1693  DNA ligase (NAD+)  50.53 
 
 		 675 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000392244  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  720    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  52.25 
 
 		 671 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  55.36 
 
 		 684 aa  741    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  53.79 
 
 		 663 aa  723    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  52.25 
 
 		 668 aa  673    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  54.34 
 
 		 671 aa  704    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  53.3 
 
 		 688 aa  711    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  718    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0647  DNA ligase, NAD-dependent  50.07 
 
 		 707 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.407599  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  47.61 
 
 		 680 aa  641    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  59.76 
 
 		 666 aa  778    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0693  DNA ligase, NAD-dependent  51.34 
 
 		 687 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.600829  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  52.77 
 
 		 726 aa  681    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  56.5 
 
 		 662 aa  749    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  50.29 
 
 		 697 aa  653    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  47.85 
 
 		 674 aa  638    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.6 
 
 		 669 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  53.53 
 
 		 669 aa  709    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  53.52 
 
 		 718 aa  679    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  49.14 
 
 		 721 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  54.27 
 
 		 683 aa  698    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  52.48 
 
 		 673 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  50.46 
 
 		 667 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  49.25 
 
 		 684 aa  646    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  60.03 
 
 		 670 aa  828    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0327  DNA ligase, NAD-dependent  54.12 
 
 		 685 aa  668    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  53.88 
 
 		 672 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1222  DNA ligase, NAD-dependent  52.94 
 
 		 712 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0729  DNA ligase, NAD-dependent  50.87 
 
 		 687 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  51.75 
 
 		 673 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0728  DNA ligase, NAD-dependent  51.02 
 
 		 687 aa  643    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  54.37 
 
 		 661 aa  711    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1816  DNA ligase, NAD-dependent  50.89 
 
 		 707 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.633094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  60.36 
 
 		 677 aa  835    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  48.33 
 
 		 662 aa  662    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  49.62 
 
 		 681 aa  655    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.35 
 
 		 669 aa  717    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  48.32 
 
 		 668 aa  637    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  52.58 
 
 		 681 aa  679    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 694 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 672 aa  1348    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  53.3 
 
 		 688 aa  711    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  50.53 
 
 		 663 aa  687    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  53.95 
 
 		 673 aa  716    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1433  DNA ligase, NAD-dependent  49.34 
 
 		 704 aa  636    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  50.46 
 
 		 667 aa  677    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  49.26 
 
 		 706 aa  634  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  49.63 
 
 		 700 aa  634  1e-180  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  49.77 
 
 		 679 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.33 
 
 		 738 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2201  DNA ligase, NAD-dependent  50.37 
 
 		 690 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.378461  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  48.71 
 
 		 705 aa  630  1e-179  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  49.03 
 
 		 673 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.2 
 
 		 673 aa  625  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0801  DNA ligase, NAD-dependent  49.04 
 
 		 678 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  50.3 
 
 		 683 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2190  DNA ligase, NAD-dependent  51.14 
 
 		 693 aa  620  1e-176  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0728062  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  47.08 
 
 		 673 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2205  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.16 
 
 		 680 aa  615  1e-175  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1881  DNA ligase (NAD+)  47.88 
 
 		 674 aa  617  1e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.605724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  48.78 
 
 		 671 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0694  DNA ligase, NAD-dependent  49.18 
 
 		 695 aa  615  1e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2364  DNA ligase, NAD-dependent  47.56 
 
 		 685 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0084265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  46.96 
 
 		 689 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2552  NAD-dependent DNA ligase LigA  48.59 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  48.48 
 
 		 671 aa  610  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0735  DNA ligase, NAD-dependent  49.57 
 
 		 699 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  46.63 
 
 		 673 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  47.66 
 
 		 691 aa  608  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  49.26 
 
 		 688 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  47.11 
 
 		 690 aa  611  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>