More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1021 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
197 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  58.18 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  53.99 
 
 
179 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  54.32 
 
 
190 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  53.85 
 
 
182 aa  168  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  44.86 
 
 
199 aa  150  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.25 
 
 
195 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  43.59 
 
 
201 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  41.76 
 
 
187 aa  134  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  38.98 
 
 
188 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  45.03 
 
 
187 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.86 
 
 
219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 
218 aa  129  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  41.38 
 
 
181 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  43.29 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  40.8 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  42.76 
 
 
709 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  41.4 
 
 
603 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
709 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  46.62 
 
 
690 aa  119  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 
719 aa  115  5e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  42.11 
 
 
698 aa  115  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  44.74 
 
 
763 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  44.08 
 
 
763 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  44.08 
 
 
830 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 
729 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  38.51 
 
 
798 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 
661 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.25 
 
 
642 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  39.07 
 
 
715 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  40.14 
 
 
660 aa  108  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  42.25 
 
 
642 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  36.99 
 
 
724 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40.74 
 
 
663 aa  107  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  41.21 
 
 
166 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  41.72 
 
 
214 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 
649 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.14 
 
 
649 aa  105  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.74 
 
 
721 aa  104  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  42.21 
 
 
677 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  40.91 
 
 
717 aa  103  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40.85 
 
 
650 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  39.87 
 
 
641 aa  103  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.85 
 
 
642 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  40 
 
 
677 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  39.24 
 
 
644 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 
720 aa  103  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 
643 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 
833 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 
748 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 
637 aa  102  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 
730 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 
730 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 
735 aa  101  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 
660 aa  101  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  40.14 
 
 
657 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  40.14 
 
 
649 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  40.14 
 
 
641 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.56 
 
 
669 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  40.14 
 
 
642 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  40.14 
 
 
642 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  40.4 
 
 
593 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  40.4 
 
 
593 aa  99.8  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  35.11 
 
 
681 aa  100  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 
657 aa  99.8  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  38.56 
 
 
657 aa  99.4  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  41.56 
 
 
756 aa  99  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  35.44 
 
 
642 aa  99  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.25 
 
 
747 aa  98.6  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  35.76 
 
 
731 aa  98.2  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 
661 aa  98.2  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 
650 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 
650 aa  97.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  40.13 
 
 
661 aa  97.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  40.14 
 
 
647 aa  97.8  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
296 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
735 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 
650 aa  97.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  40 
 
 
285 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 
650 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.54 
 
 
663 aa  96.7  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 
296 aa  97.1  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  38.56 
 
 
782 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 
650 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 
650 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.57 
 
 
260 aa  95.9  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 
607 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 
777 aa  95.5  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.79 
 
 
638 aa  95.9  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 
750 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  37.84 
 
 
643 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
642 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  41.4 
 
 
750 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  38.85 
 
 
650 aa  95.1  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  40.26 
 
 
750 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.97 
 
 
643 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
643 aa  94.7  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  32.67 
 
 
739 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  37.18 
 
 
651 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  37.18 
 
 
651 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>