More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2352 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2352  resolvase domain-containing protein  100 
 
 		 564 aa  1135    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1822  resolvase domain-containing protein  54.62 
 
 		 576 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1755  resolvase domain-containing protein  53.29 
 
 		 549 aa  569  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344907  normal  0.0981006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1972  recombinase  50.08 
 
 		 578 aa  571  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.233467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1061  Resolvase domain  51.36 
 
 		 578 aa  556  1e-157  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.190833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3326  recombinase  52.58 
 
 		 601 aa  556  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0106  recombinase  53.15 
 
 		 597 aa  552  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0109495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0994  Recombinase  52.06 
 
 		 569 aa  543  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1616  Resolvase domain  51.05 
 
 		 565 aa  530  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3123  recombinase  49.03 
 
 		 552 aa  528  1e-149  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4572  resolvase domain-containing protein  47.6 
 
 		 584 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.118151  decreased coverage  0.0082878 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3135  recombinase  48.23 
 
 		 551 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  47.72 
 
 		 662 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1074  Resolvase domain  49.56 
 
 		 562 aa  514  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.324601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0396  recombinase  47.19 
 
 		 558 aa  498  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0105  recombinase  50.57 
 
 		 549 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0106317 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3864  recombinase  43.06 
 
 		 537 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.802308  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2841  resolvase  67.13 
 
 		 336 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.8273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2219  recombinase  38.7 
 
 		 541 aa  333  4e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.543065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1563  resolvase domain-containing protein  36.27 
 
 		 540 aa  330  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.681987  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3959  recombinase  38.49 
 
 		 542 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0990  recombinase  38.52 
 
 		 542 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.265187  decreased coverage  0.00000829411 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3608  hypothetical protein  36.54 
 
 		 539 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2219  recombinase  37.87 
 
 		 558 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338837  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3853  hypothetical protein  39.09 
 
 		 546 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.701887 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1759  Resolvase domain  66.37 
 
 		 251 aa  291  3e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.621745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0834  recombinase  61.4 
 
 		 277 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.315619  hitchhiker  0.000339857 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37130  Recombinase  36.76 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4107  site-specific recombinase  34.8 
 
 		 564 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2336  recombinase  35.14 
 
 		 532 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430525  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3842  Resolvase domain  31.96 
 
 		 626 aa  195  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  28.82 
 
 		 506 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  25.68 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4799  recombinase  33.33 
 
 		 564 aa  156  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284934  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  26.79 
 
 		 485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5404  Recombinase  29.68 
 
 		 738 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  28.31 
 
 		 479 aa  130  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  24.9 
 
 		 517 aa  130  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  26.9 
 
 		 496 aa  130  9.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  27.25 
 
 		 510 aa  124  3e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  24.84 
 
 		 546 aa  123  9e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  25.73 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  25.57 
 
 		 515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  24.91 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.12 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.12 
 
 		 542 aa  117  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  23.91 
 
 		 542 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 		 542 aa  114  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.22 
 
 		 554 aa  114  6e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  27.14 
 
 		 540 aa  113  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  23.85 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  26.63 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_215  resolvase domain protein, PinR type  24.91 
 
 		 563 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  27.36 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4582  site-specific recombinase  27.53 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  27.05 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2604  resolvase family site-specific recombinase  24.08 
 
 		 552 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0107725  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0627  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 516 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  26.65 
 
 		 590 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1541  recombinase  31.41 
 
 		 414 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.343961  normal  0.0432678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0551  site-specific recombinase  24.89 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000944856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  25.05 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  24.65 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.46 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  24.35 
 
 		 548 aa  101  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5403  Resolvase domain  32.04 
 
 		 279 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0521163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  25.92 
 
 		 539 aa  100  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0979  Resolvase domain  28.47 
 
 		 678 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.127172 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2236  Recombinase  30.79 
 
 		 430 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3843  Resolvase domain  30.03 
 
 		 707 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0427  Resolvase domain protein  25.37 
 
 		 534 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  24.39 
 
 		 537 aa  99.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1345  recombinase  26.34 
 
 		 515 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.667193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  27.71 
 
 		 475 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4059  Resolvase domain  28.01 
 
 		 862 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932376  normal  0.13959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  23.05 
 
 		 521 aa  98.2  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.15 
 
 		 462 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  26.61 
 
 		 561 aa  97.4  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4182  resolvase domain-containing protein  24.58 
 
 		 579 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0876  TnpX site-specific recombinase family protein  24.9 
 
 		 550 aa  97.1  8e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  26.73 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  28.24 
 
 		 429 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1467  site-specific recombinase, putative  25.55 
 
 		 551 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00705906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0980  Resolvase domain  27.7 
 
 		 707 aa  95.1  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0578275 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  26.61 
 
 		 522 aa  93.6  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1112  hypothetical protein  51.61 
 
 		 170 aa  93.2  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2606  resolvase family site-specific recombinase  21.87 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1090  recombinase  26.77 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3623  recombinase  25.89 
 
 		 515 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1490  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  24.31 
 
 		 553 aa  92.8  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0819  recombinase  29.15 
 
 		 540 aa  92  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  28.78 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  26.83 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2440  Resolvase domain protein  23.99 
 
 		 500 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0480  recombinase  23.38 
 
 		 515 aa  89.7  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.63808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02510  Recombinase  27.62 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2906  resolvase family site-specific recombinase  27.62 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02474  hypothetical protein  27.62 
 
 		 518 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.665428  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1069  phage integrase family site specific recombinase  23.74 
 
 		 519 aa  88.6  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.278434  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2591  Resolvase domain protein  24.72 
 
 		 490 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0023015  hitchhiker  0.000000886482 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>