More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1236 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1236  Triose-phosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  488  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3166  Triose-phosphate isomerase  60.56 
 
 		 250 aa  289  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136531  normal  0.155629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1835  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.83515  normal  0.420949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5400  Triose-phosphate isomerase  59.92 
 
 		 253 aa  260  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3233  Triose-phosphate isomerase  56.69 
 
 		 258 aa  258  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1736  triosephosphate isomerase  56.75 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2795  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 261 aa  254  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2471  triosephosphate isomerase  56.3 
 
 		 257 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0885036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2826  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 		 257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4480  triosephosphate isomerase  56.22 
 
 		 251 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4305  Triose-phosphate isomerase  58.44 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5571  triosephosphate isomerase  57.94 
 
 		 253 aa  248  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0343  Triose-phosphate isomerase  57.77 
 
 		 245 aa  247  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1947  triosephosphate isomerase  56.52 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0598  Triose-phosphate isomerase  56.52 
 
 		 245 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.441113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0764  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2230  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 		 256 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2769  Triose-phosphate isomerase  56.4 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.216684  hitchhiker  0.00002221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1889  triosephosphate isomerase  57.31 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193197  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1067  triosephosphate isomerase  52.4 
 
 		 256 aa  242  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.331655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2051  triosephosphate isomerase  55.65 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4380  Triose-phosphate isomerase  56.4 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0154  Triose-phosphate isomerase  51.56 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1097  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1138  triosephosphate isomerase  54.84 
 
 		 254 aa  238  8e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1733  triosephosphate isomerase  54.4 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0214124  normal  0.405156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3104  Triose-phosphate isomerase  53.17 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.275124  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5206  Triose-phosphate isomerase  52.19 
 
 		 254 aa  229  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2031  triosephosphate isomerase  51.6 
 
 		 256 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5129  Triose-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.246161 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4666  Triose-phosphate isomerase  52.4 
 
 		 254 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1636  triosephosphate isomerase  52.59 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1834  triosephosphate isomerase  51.2 
 
 		 256 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113682  normal  0.0103278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 245 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0528  triosephosphate isomerase  50.2 
 
 		 254 aa  223  3e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1450  Triose-phosphate isomerase  51.68 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  52 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  52.42 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2064  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0168982  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2350  triosephosphate isomerase  56.13 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1401  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0615206  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  50.79 
 
 		 246 aa  213  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1499  Triose-phosphate isomerase  47.79 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0165539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1405  triosephosphate isomerase  57.37 
 
 		 256 aa  212  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.194664  hitchhiker  0.0000346461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  45.2 
 
 		 250 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  46.15 
 
 		 245 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2078  triosephosphate isomerase  48.59 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1740  triosephosphate isomerase  51.39 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 251 aa  208  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0508  Triose-phosphate isomerase  50 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.584203 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  48.82 
 
 		 251 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 249 aa  204  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.43 
 
 		 253 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  48.58 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49960  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45770  triosephosphate isomerase  49.58 
 
 		 251 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1026  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00133267  normal  0.306303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  46.09 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  44.31 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2168  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00524142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2289  triosephosphate isomerase  46.85 
 
 		 251 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000785898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3935  triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00010757  normal  0.914781 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  42.91 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  47.43 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 249 aa  198  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0955  triosephosphate isomerase  48.21 
 
 		 250 aa  198  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301152 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 254 aa  197  9e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1287  triosephosphate isomerase  47.08 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  42.68 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  48.45 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0238  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2019  triosephosphate isomerase  51.41 
 
 		 256 aa  196  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0267  triosephosphate isomerase  45.2 
 
 		 249 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4805  triosephosphate isomerase  43.5 
 
 		 255 aa  195  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000667098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  47.58 
 
 		 250 aa  195  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  42.19 
 
 		 252 aa  195  7e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  44.4 
 
 		 257 aa  195  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  45.53 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  41.57 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  48.03 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0499  Triose-phosphate isomerase  45.38 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 249 aa  193  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3512  triosephosphate isomerase  49.03 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  43.87 
 
 		 253 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  43.85 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3277  triosephosphate isomerase  39.84 
 
 		 251 aa  192  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000689826  hitchhiker  0.00599286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 255 aa  192  5e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2815  triosephosphate isomerase  46.33 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.394294  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0304  Triose-phosphate isomerase  46.56 
 
 		 257 aa  191  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1491  triosephosphate isomerase  45.88 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.020715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>