More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0619 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
810 aa  1610    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 
823 aa  389  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.57 
 
 
805 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.01 
 
 
813 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31 
 
 
807 aa  379  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.23 
 
 
796 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.9 
 
 
817 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  32.77 
 
 
814 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  34.02 
 
 
869 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.09 
 
 
822 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.73 
 
 
821 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.89 
 
 
807 aa  362  1e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 
862 aa  362  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.56 
 
 
882 aa  356  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.42 
 
 
816 aa  353  5e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.69 
 
 
871 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  33.45 
 
 
805 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.55 
 
 
798 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  33.33 
 
 
809 aa  336  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.4 
 
 
805 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.6 
 
 
805 aa  333  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  34.02 
 
 
819 aa  331  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  31.04 
 
 
802 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  32.97 
 
 
816 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  31.41 
 
 
804 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.11 
 
 
821 aa  324  5e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.01 
 
 
865 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  33.41 
 
 
804 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.37 
 
 
803 aa  319  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.56 
 
 
893 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.82 
 
 
805 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.17 
 
 
913 aa  308  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.01 
 
 
915 aa  308  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.4 
 
 
844 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.41 
 
 
808 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.19 
 
 
810 aa  302  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.4 
 
 
809 aa  301  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  33.96 
 
 
811 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  29.19 
 
 
809 aa  298  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.6 
 
 
887 aa  296  8e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.48 
 
 
855 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.2 
 
 
812 aa  293  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  30.31 
 
 
805 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  29.44 
 
 
797 aa  290  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  31.7 
 
 
808 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  28.77 
 
 
831 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.02 
 
 
849 aa  283  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  31.75 
 
 
808 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  30.53 
 
 
803 aa  281  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  28.14 
 
 
845 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  32.62 
 
 
810 aa  277  6e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.53 
 
 
879 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  30.99 
 
 
887 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.54 
 
 
820 aa  270  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.71 
 
 
808 aa  270  7e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.47 
 
 
808 aa  270  7e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.74 
 
 
878 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.81 
 
 
806 aa  268  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  29.52 
 
 
817 aa  265  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 
817 aa  263  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30 
 
 
883 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.89 
 
 
843 aa  260  6e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.95 
 
 
803 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 
828 aa  254  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.39 
 
 
919 aa  250  6e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.63 
 
 
888 aa  247  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.24 
 
 
874 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.74 
 
 
884 aa  239  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  31.11 
 
 
835 aa  239  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  28.61 
 
 
800 aa  238  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  29.47 
 
 
844 aa  234  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.31 
 
 
846 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
813 aa  229  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  31.53 
 
 
819 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.51 
 
 
880 aa  222  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  29.63 
 
 
848 aa  221  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  25.53 
 
 
810 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.81 
 
 
810 aa  211  4e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.09 
 
 
807 aa  205  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  24.88 
 
 
809 aa  191  5.999999999999999e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  28.96 
 
 
861 aa  180  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  28.49 
 
 
931 aa  177  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 
808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 
795 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 
793 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
770 aa  121  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 
805 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
806 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 
795 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 
791 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
798 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.21 
 
 
793 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 
804 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  22.07 
 
 
809 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 
813 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
805 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.99 
 
 
789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
800 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  22.84 
 
 
830 aa  111  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 
792 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>