More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0618 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  100 
 
 
822 aa  1657    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.9 
 
 
817 aa  525  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.64 
 
 
805 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.32 
 
 
807 aa  510  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.59 
 
 
813 aa  507  9.999999999999999e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.77 
 
 
823 aa  505  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  37.56 
 
 
821 aa  502  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.29 
 
 
882 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.53 
 
 
814 aa  488  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  37.91 
 
 
869 aa  485  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.49 
 
 
805 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  38.31 
 
 
871 aa  475  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.3 
 
 
816 aa  466  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  36.07 
 
 
805 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  36.4 
 
 
796 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.9 
 
 
805 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.48 
 
 
807 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.96 
 
 
809 aa  444  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.29 
 
 
805 aa  436  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  33.9 
 
 
797 aa  436  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  35.29 
 
 
804 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  35.71 
 
 
831 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.98 
 
 
862 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  35.63 
 
 
804 aa  424  1e-117  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  34.82 
 
 
809 aa  420  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  33.17 
 
 
798 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  37.65 
 
 
808 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.97 
 
 
913 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.61 
 
 
878 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  34.58 
 
 
865 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.45 
 
 
802 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.95 
 
 
821 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  35.68 
 
 
808 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  34.9 
 
 
803 aa  399  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  34.62 
 
 
800 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.72 
 
 
844 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.04 
 
 
915 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.45 
 
 
893 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  33.82 
 
 
805 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.77 
 
 
883 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.97 
 
 
879 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  33.57 
 
 
817 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  33.29 
 
 
808 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  34.34 
 
 
819 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  33.37 
 
 
887 aa  385  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  35.92 
 
 
808 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.94 
 
 
808 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.03 
 
 
810 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  31.07 
 
 
845 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  32.13 
 
 
809 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.21 
 
 
849 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.88 
 
 
811 aa  376  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  32.94 
 
 
810 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.46 
 
 
817 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  33.45 
 
 
816 aa  365  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.29 
 
 
855 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.42 
 
 
812 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.56 
 
 
874 aa  351  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  33.57 
 
 
806 aa  346  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  31.93 
 
 
803 aa  344  4e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  31.73 
 
 
887 aa  341  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.38 
 
 
843 aa  335  2e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  30.54 
 
 
803 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.07 
 
 
820 aa  331  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  32.01 
 
 
844 aa  330  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.79 
 
 
884 aa  329  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.68 
 
 
888 aa  328  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  34.92 
 
 
819 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  31.15 
 
 
810 aa  323  8e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.06 
 
 
880 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.29 
 
 
810 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.12 
 
 
846 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.99 
 
 
919 aa  305  2.0000000000000002e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.34 
 
 
848 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.83 
 
 
835 aa  299  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.29 
 
 
861 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 
809 aa  287  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.87 
 
 
813 aa  280  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  29.3 
 
 
810 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  28.11 
 
 
807 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.05 
 
 
828 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  29 
 
 
931 aa  220  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
770 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 
805 aa  147  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 
807 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 
817 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  23.9 
 
 
816 aa  142  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.7 
 
 
784 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2247  protein of unknown function DUF214  24.96 
 
 
805 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  22.71 
 
 
788 aa  138  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24 
 
 
802 aa  138  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 
801 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  23.54 
 
 
830 aa  135  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 
792 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 
793 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
790 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 
810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  25.92 
 
 
811 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 
795 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  24.35 
 
 
813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>