More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3605 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1307  alpha amylase catalytic region  56.2 
 
 		 652 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3605  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 643 aa  1317    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3322  alpha amylase catalytic region  64.01 
 
 		 672 aa  812    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25520  glycosidase  65.2 
 
 		 642 aa  790    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.563974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2030  alpha amylase, catalytic region  77.17 
 
 		 638 aa  1020    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.194844  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0218  Alpha amylase, catalytic region  51.47 
 
 		 650 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3820  alpha amylase, catalytic region  49.67 
 
 		 645 aa  601  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.166544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00676  alpha-amylase, amylosucrase  47.17 
 
 		 649 aa  598  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.145273  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3684  alpha amylase catalytic region  48.28 
 
 		 663 aa  590  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0305  alpha amylase, catalytic region  47.87 
 
 		 646 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0324  alpha amylase catalytic region  45.63 
 
 		 641 aa  533  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3590  alpha amylase catalytic region  43.8 
 
 		 661 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0704974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3860  alpha amylase catalytic region  47.21 
 
 		 667 aa  499  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0972  alpha amylase catalytic region  44.78 
 
 		 644 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0308  alpha amylase catalytic subunit  42.7 
 
 		 636 aa  490  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2914  alpha amylase catalytic region  41.24 
 
 		 650 aa  485  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1797  Alpha amylase, catalytic region  41.8 
 
 		 651 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126302  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1690  alpha amylase catalytic region  48.13 
 
 		 639 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.526546  normal  0.114706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1153  alpha amylase catalytic region  41.92 
 
 		 657 aa  476  1e-133  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00213284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2611  alpha amylase, catalytic region  40.51 
 
 		 650 aa  472  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0572  alpha amylase, catalytic region  44.52 
 
 		 650 aa  474  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3514  alpha amylase, catalytic region  40.65 
 
 		 651 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.482546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1267  alpha amylase, catalytic region  45.54 
 
 		 645 aa  431  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02416  alpha-amlyase  38.02 
 
 		 638 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  25.73 
 
 		 551 aa  188  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  27.05 
 
 		 1085 aa  187  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  26.64 
 
 		 553 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  27.1 
 
 		 1088 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  26.12 
 
 		 1100 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  26.26 
 
 		 1088 aa  182  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  26.26 
 
 		 1088 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  25.88 
 
 		 1088 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1799  alpha amylase catalytic region  27.47 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  26.43 
 
 		 1092 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  26.92 
 
 		 1154 aa  178  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  28.47 
 
 		 1098 aa  177  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  29.92 
 
 		 567 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  26.5 
 
 		 1094 aa  176  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  26.22 
 
 		 1102 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  27.21 
 
 		 572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  27.38 
 
 		 553 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  27.38 
 
 		 572 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  26.57 
 
 		 1152 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  27.29 
 
 		 1099 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  27.23 
 
 		 1098 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  26.18 
 
 		 1102 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  25.77 
 
 		 1100 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  26.56 
 
 		 1154 aa  172  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  26.56 
 
 		 1101 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  26.18 
 
 		 1102 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  27.21 
 
 		 1108 aa  172  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  26.98 
 
 		 1100 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  23.95 
 
 		 1109 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  25.63 
 
 		 1114 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  25.62 
 
 		 1110 aa  171  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  27.01 
 
 		 556 aa  171  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  25.63 
 
 		 1113 aa  170  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  26.23 
 
 		 1100 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  27.72 
 
 		 1099 aa  170  8e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  26.83 
 
 		 1100 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  25.91 
 
 		 548 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  25.05 
 
 		 1116 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  24.32 
 
 		 1112 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  26.26 
 
 		 1121 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  25.9 
 
 		 1094 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  25.99 
 
 		 551 aa  169  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  25.05 
 
 		 1116 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  26.32 
 
 		 1105 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  26.22 
 
 		 1104 aa  167  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  26.1 
 
 		 1100 aa  167  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1983  alpha amylase domain-containing protein  28.15 
 
 		 1098 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  26.67 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  25.17 
 
 		 1061 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  25.71 
 
 		 1108 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  26.58 
 
 		 1164 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  26.58 
 
 		 1164 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  25.95 
 
 		 1106 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  25.77 
 
 		 1108 aa  165  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  25.95 
 
 		 1106 aa  165  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  24.72 
 
 		 1115 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  24.54 
 
 		 1142 aa  164  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  26.57 
 
 		 1137 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  25.19 
 
 		 1113 aa  164  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  25.45 
 
 		 1139 aa  164  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  25.53 
 
 		 567 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 1100 aa  164  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  24.58 
 
 		 1088 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  25.63 
 
 		 571 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  25.14 
 
 		 1093 aa  163  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  26.87 
 
 		 1130 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  25.41 
 
 		 1100 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  24.58 
 
 		 1093 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  30.23 
 
 		 587 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  23.77 
 
 		 1105 aa  162  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  26.39 
 
 		 1137 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1160 aa  161  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  24.15 
 
 		 1123 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  26.59 
 
 		 1095 aa  161  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 1138 aa  161  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  26.39 
 
 		 1136 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>