More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1178 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  100 
 
 
847 aa  1638    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  43.01 
 
 
843 aa  591  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  43.78 
 
 
842 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  42.26 
 
 
834 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  41.05 
 
 
848 aa  526  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  40.09 
 
 
845 aa  482  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  38.12 
 
 
852 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  38.38 
 
 
853 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  35.23 
 
 
849 aa  391  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  36.83 
 
 
859 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  35.55 
 
 
873 aa  382  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  36 
 
 
856 aa  377  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  35.23 
 
 
849 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  35.78 
 
 
806 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  34.2 
 
 
855 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  35.97 
 
 
853 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.35 
 
 
861 aa  351  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  35.42 
 
 
853 aa  350  5e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  32.36 
 
 
854 aa  347  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  32.45 
 
 
836 aa  347  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  36.97 
 
 
873 aa  345  2e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  33.21 
 
 
825 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  34.82 
 
 
857 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
861 aa  306  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  33.14 
 
 
838 aa  295  3e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.77 
 
 
866 aa  292  2e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  33.66 
 
 
841 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 
839 aa  262  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  34.63 
 
 
828 aa  262  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  31.32 
 
 
855 aa  248  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  29.55 
 
 
821 aa  241  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.81 
 
 
846 aa  227  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  32.16 
 
 
801 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 
897 aa  204  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
930 aa  190  9e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.31 
 
 
835 aa  186  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.37 
 
 
859 aa  181  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.17 
 
 
863 aa  180  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  27.46 
 
 
854 aa  177  9e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.77 
 
 
855 aa  174  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.38 
 
 
849 aa  162  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
855 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.42 
 
 
880 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.1 
 
 
851 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.3 
 
 
857 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  27.72 
 
 
878 aa  140  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.8 
 
 
855 aa  139  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.33 
 
 
852 aa  137  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 
846 aa  137  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  25.44 
 
 
850 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  22.07 
 
 
858 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  27.29 
 
 
822 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  20.39 
 
 
856 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  27.95 
 
 
828 aa  129  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.36 
 
 
850 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  28.35 
 
 
807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  24.22 
 
 
858 aa  119  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
844 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  26.81 
 
 
822 aa  116  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.48 
 
 
849 aa  115  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  24.16 
 
 
870 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  32.37 
 
 
842 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  25.9 
 
 
846 aa  115  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  26.31 
 
 
847 aa  114  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.24 
 
 
841 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  32.08 
 
 
842 aa  109  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.5 
 
 
842 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 
847 aa  107  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 
857 aa  107  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 
845 aa  102  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  23.8 
 
 
866 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  25.43 
 
 
858 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  40.82 
 
 
871 aa  90.9  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3051  ABC transporter, permease  20.75 
 
 
829 aa  90.5  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3141  ABC transporter, permease  20.75 
 
 
829 aa  90.1  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.121137  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  25.9 
 
 
822 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  26.23 
 
 
857 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  27 
 
 
841 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  35.32 
 
 
826 aa  87  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  23.3 
 
 
867 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
386 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.66 
 
 
413 aa  85.1  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34.09 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.15 
 
 
386 aa  84.7  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 
837 aa  84  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.7 
 
 
839 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.11 
 
 
443 aa  81.6  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  26.56 
 
 
843 aa  80.9  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  31.02 
 
 
390 aa  80.5  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 
884 aa  80.5  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.24 
 
 
408 aa  80.9  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.99 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  25.85 
 
 
838 aa  80.1  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
386 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.26 
 
 
396 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  27.27 
 
 
400 aa  78.6  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 
874 aa  77.8  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
430 aa  77.8  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  22.89 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  29.15 
 
 
408 aa  77  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>