119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0805 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 472 aa  941    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  55.65 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  53.18 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  47.37 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  47.37 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  47.67 
 
 		 438 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  45.31 
 
 		 479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 463 aa  326  7e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  36.64 
 
 		 474 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  33.56 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 484 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.63 
 
 		 495 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  32.05 
 
 		 503 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  30.57 
 
 		 521 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  29.08 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.48 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  22.86 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.35 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  22.61 
 
 		 307 aa  55.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  22.36 
 
 		 307 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 317 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.66 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  24.54 
 
 		 290 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 318 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 318 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.7 
 
 		 318 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  23.65 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  35.16 
 
 		 253 aa  53.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 321 aa  52.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  35.34 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.25 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  35.16 
 
 		 256 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  20.57 
 
 		 295 aa  52.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  26.07 
 
 		 324 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  23.85 
 
 		 307 aa  50.8  0.00005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  24.87 
 
 		 315 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  21.68 
 
 		 296 aa  50.8  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  29.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  29.34 
 
 		 410 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  29.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  29.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  29.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  29.34 
 
 		 385 aa  50.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  19.44 
 
 		 328 aa  50.1  0.00008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  21.46 
 
 		 379 aa  50.1  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  33.72 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  20.48 
 
 		 307 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  24.65 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.22 
 
 		 299 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  23.45 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.42 
 
 		 301 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  34.86 
 
 		 321 aa  48.5  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  25.55 
 
 		 311 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  30.3 
 
 		 299 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  30.7 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.16 
 
 		 299 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  22.01 
 
 		 381 aa  47  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.32 
 
 		 296 aa  47  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  23.53 
 
 		 305 aa  47  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  19.89 
 
 		 299 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  20.4 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  31.94 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 295 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.13 
 
 		 324 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2366  integrase family protein  26.34 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.18523  hitchhiker  0.000000198716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2746  tyrosine recombinase XerC  26.34 
 
 		 314 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  23.87 
 
 		 292 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  24.67 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  32.31 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.17 
 
 		 296 aa  45.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  32.32 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  32.31 
 
 		 302 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.5 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  35.05 
 
 		 331 aa  45.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  32.52 
 
 		 311 aa  45.8  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0915  Tn916, transposase  22.77 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  31.78 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  34.38 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  31.78 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  32.08 
 
 		 301 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2016  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 333 aa  45.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  29.36 
 
 		 317 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  25.12 
 
 		 314 aa  45.1  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.69 
 
 		 299 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1733  integrase family protein  31.91 
 
 		 333 aa  44.7  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>