30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5287 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  991    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  66.46 
 
 		 503 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  34.11 
 
 		 472 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  31.61 
 
 		 508 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 479 aa  156  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  28.64 
 
 		 479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  31.6 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  29.37 
 
 		 474 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  26.62 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  26.62 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  27.32 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  25 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  26.29 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  25.37 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  23.16 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.48 
 
 		 307 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  26.46 
 
 		 521 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.18 
 
 		 297 aa  43.9  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  22.31 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  22.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  22.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  22.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  22.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  22.14 
 
 		 385 aa  43.5  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  21.41 
 
 		 372 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  33.83 
 
 		 364 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  33.83 
 
 		 364 aa  43.5  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  28.28 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>