47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0166 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  100 
 
 		 474 aa  956    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0805  integrase domain-containing protein  35.8 
 
 		 472 aa  224  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0387605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2255  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.19 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.204613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3164  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  32.95 
 
 		 479 aa  197  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3929  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.050158  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4144  phage integrase-like SAM-like  33.41 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4229  phage integrase-like SAM-like  31.82 
 
 		 479 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  33.09 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  33.09 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  32.93 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2813  integrase domain-containing protein  31.59 
 
 		 521 aa  161  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2618  hypothetical protein  31.9 
 
 		 437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.190831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  29.85 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  25.85 
 
 		 397 aa  118  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  28.98 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  22.29 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.82 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  21.63 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  24.1 
 
 		 402 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  33.06 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  22.53 
 
 		 411 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  23.19 
 
 		 392 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.59 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.28 
 
 		 294 aa  48.5  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  24.32 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  24.32 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  24.32 
 
 		 334 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  27.6 
 
 		 323 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  23.38 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  24.75 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  24.75 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  33 
 
 		 141 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  22.25 
 
 		 296 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  29.58 
 
 		 308 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.08 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25.23 
 
 		 314 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 296 aa  44.3  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.48 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  30.92 
 
 		 373 aa  43.9  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 377 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 377 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  20.59 
 
 		 299 aa  43.1  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>