80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6272 on replicon NC_010070
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  86.48 
 
 
392 aa  701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  88.27 
 
 
392 aa  721    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  100 
 
 
411 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  31.58 
 
 
379 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  30.48 
 
 
402 aa  171  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  27.53 
 
 
377 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  27.53 
 
 
377 aa  143  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  30.5 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  29.75 
 
 
381 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  26.41 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  26.41 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  26.41 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  26.41 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  26.41 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  26.41 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  25.74 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  23.8 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  24.82 
 
 
445 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.28 
 
 
308 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  21.75 
 
 
361 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  22.05 
 
 
474 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  21.56 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  23.92 
 
 
373 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  26.27 
 
 
298 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  21.02 
 
 
295 aa  47  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  25.16 
 
 
296 aa  47.4  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 
331 aa  47  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  32.31 
 
 
324 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.48 
 
 
311 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.73 
 
 
321 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  20.38 
 
 
253 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  34.75 
 
 
299 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  29.08 
 
 
298 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  24.1 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  24.1 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  24.1 
 
 
349 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 
290 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  26.47 
 
 
296 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  24.91 
 
 
286 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  22.12 
 
 
295 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  25.6 
 
 
314 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.03 
 
 
325 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  23.79 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  26.23 
 
 
344 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 
317 aa  45.8  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  29.92 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  23.52 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  23.52 
 
 
464 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  23.21 
 
 
438 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  24.23 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 
318 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  39.24 
 
 
353 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 
310 aa  44.3  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  28.46 
 
 
311 aa  44.3  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 
313 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  35.59 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  25.29 
 
 
335 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.76 
 
 
318 aa  43.9  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 
300 aa  43.9  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.87 
 
 
295 aa  43.5  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  24.07 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  24.07 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  23.05 
 
 
298 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6209  Phage integrase  24.19 
 
 
303 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  32.23 
 
 
332 aa  43.9  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4005  integrase family protein  27.84 
 
 
303 aa  43.5  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3697  integrase family protein  27.84 
 
 
303 aa  43.5  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.6 
 
 
307 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  26.21 
 
 
301 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  40.86 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  23.37 
 
 
384 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  34.78 
 
 
313 aa  43.1  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0439  phage integrase  25.69 
 
 
304 aa  43.1  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>