30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4222 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  100 
 
 		 445 aa  925    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  93.99 
 
 		 286 aa  550  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  43.95 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  49.11 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  49.11 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3588  phage integrase  97.69 
 
 		 187 aa  350  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  31.12 
 
 		 421 aa  179  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  27.33 
 
 		 469 aa  107  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  26.19 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  26.19 
 
 		 459 aa  87  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  25.61 
 
 		 482 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  23.73 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  23.73 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  23.73 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  24.19 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  24.19 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  24.6 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  24.82 
 
 		 411 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  28.12 
 
 		 301 aa  53.9  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  25.41 
 
 		 381 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4744  site-specific recombinase, phage integrase family  24.07 
 
 		 495 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13628  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  23.71 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  23.71 
 
 		 464 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  23.31 
 
 		 438 aa  47  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1590  phage integrase family protein  30.65 
 
 		 198 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0163  hypothetical protein  33.73 
 
 		 222 aa  44.3  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  23.51 
 
 		 392 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>