105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4254 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  100 
 
 		 421 aa  876    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  31.7 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  31.12 
 
 		 445 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4260  phage integrase family protein  29.95 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4396  integrase family protein  29.95 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  27.33 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3590  transposase, putative  30.83 
 
 		 286 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1899  integrase family protein  27.58 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.430371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3465  integrase family protein  27.58 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 379 aa  90.1  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6478  integrase family protein  23.51 
 
 		 482 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7324  integrase family protein  23.51 
 
 		 482 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0744771  hitchhiker  0.000888754 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0250  integrase family protein  23.51 
 
 		 482 aa  86.3  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  25.75 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  28.88 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  27.16 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4954  integrase family protein  23.51 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2775  integrase family protein  23.51 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.990262 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7602  integrase family protein  23.32 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3588  phage integrase  40.7 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  24.91 
 
 		 402 aa  62  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  26.53 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  26.53 
 
 		 410 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  26.53 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  26.53 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  26.53 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  26.53 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  25 
 
 		 342 aa  53.9  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 372 aa  53.1  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.26 
 
 		 300 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  23.76 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  25.16 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.77 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  26.02 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.02 
 
 		 300 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7459  integrase family protein  25.42 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.202368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.73 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4655  tyrosine recombinase XerC  32.29 
 
 		 365 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.223284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4288  tyrosine recombinase XerC  32.29 
 
 		 365 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.710874 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  20.91 
 
 		 675 aa  49.7  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.15 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8115  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00832586  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  30.33 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.48 
 
 		 274 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.6 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.07 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 367 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.07 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  25.5 
 
 		 320 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0769  integrase family protein  21.46 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000875329 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6462  phage integrase family protein  22.71 
 
 		 310 aa  47.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893515 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  23.64 
 
 		 300 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  21.73 
 
 		 361 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  29 
 
 		 322 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 303 aa  46.6  0.0008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  23.86 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  28 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  25.42 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.86 
 
 		 310 aa  46.2  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  25.13 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  23.81 
 
 		 329 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  24.27 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 277 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.56 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  24.37 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  30.4 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  24.92 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  23.85 
 
 		 297 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  24.92 
 
 		 354 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0528  integrase domain-containing protein  29.17 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3037  integrase domain-containing protein  29.17 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.271676 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 		 303 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.67 
 
 		 307 aa  45.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6437  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.71 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.798094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.81 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4984  integrase domain-containing protein  29.17 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  26.72 
 
 		 365 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  23.66 
 
 		 291 aa  44.3  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  27.44 
 
 		 379 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2020  hypothetical protein  23.71 
 
 		 417 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.941924  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.96 
 
 		 303 aa  44.3  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.73 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  28.79 
 
 		 345 aa  43.9  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03077  hypothetical protein  26.88 
 
 		 301 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  23.61 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  21.91 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2477  integrase family protein  29.92 
 
 		 330 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.380932  normal  0.877994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  24.81 
 
 		 326 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>