More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6060 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 457 aa  930    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4220  phage integrase family protein  24.74 
 
 		 475 aa  99.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0478552  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3513  hypothetical protein  26.25 
 
 		 507 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1638  integrase family protein  23.06 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4790  integrase family protein  23.95 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4748  site-specific recombinase, phage integrase family  26.44 
 
 		 474 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.830448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3678  hypothetical protein  22.93 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0167318  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0966  putative phage recombinase/integrase  22.25 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  22.81 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  27.68 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  24.11 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  29.73 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.42 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  23.01 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25.5 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  26.03 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 309 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1683  phage integrase family protein  26.27 
 
 		 287 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.87 
 
 		 307 aa  56.6  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 349 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  25.35 
 
 		 354 aa  55.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  21.15 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.9 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  22.81 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.31 
 
 		 313 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4785  integrase family protein  33.07 
 
 		 284 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000301446  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  25.11 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  25.11 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  25.11 
 
 		 306 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  23.59 
 
 		 301 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.99 
 
 		 302 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.01 
 
 		 330 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.31 
 
 		 308 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 300 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  24.57 
 
 		 324 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  27.27 
 
 		 353 aa  54.3  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 292 aa  54.3  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  24.57 
 
 		 324 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.1 
 
 		 295 aa  54.3  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 295 aa  53.9  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  24.57 
 
 		 324 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.42 
 
 		 300 aa  53.9  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2013  integrase family protein  25.81 
 
 		 287 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000617639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2736  integrase family protein  25.81 
 
 		 287 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0269003  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 		 308 aa  53.5  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.11 
 
 		 305 aa  53.5  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  20.8 
 
 		 296 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  28.17 
 
 		 354 aa  53.5  0.000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0601  phage integrase family protein  28.23 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.81 
 
 		 295 aa  53.5  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1162  integrase family protein  25.81 
 
 		 287 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1189  integrase family protein  25.81 
 
 		 287 aa  53.5  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00933678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.93 
 
 		 315 aa  53.5  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1723  integrase family protein  25.81 
 
 		 210 aa  53.1  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0273744  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 319 aa  53.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  22.16 
 
 		 332 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  29.49 
 
 		 299 aa  53.1  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1519  integrase family protein  28.19 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959361  decreased coverage  3.1361700000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  23.19 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  25.62 
 
 		 297 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.03 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.55 
 
 		 302 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3398  integrase  26.21 
 
 		 293 aa  53.1  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.292469  normal  0.438437 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  27.72 
 
 		 325 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.55 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  27.05 
 
 		 323 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  20.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  26.78 
 
 		 288 aa  52.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  24.67 
 
 		 306 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.88 
 
 		 297 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.32 
 
 		 328 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  24.45 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1237  integrase family protein  25.59 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.85 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3706  integrase family protein  25.59 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000354013  normal  0.710204 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  23.01 
 
 		 290 aa  51.6  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  25 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.88 
 
 		 324 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  26.6 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 311 aa  51.2  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2522  integrase family protein  25.59 
 
 		 334 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000359584  hitchhiker  0.00166754 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  20.28 
 
 		 361 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  32.87 
 
 		 295 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  25 
 
 		 341 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 313 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.65 
 
 		 303 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  20.36 
 
 		 302 aa  51.2  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.24 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.53 
 
 		 317 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>