161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0966 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0966  putative phage recombinase/integrase  100 
 
 		 453 aa  939    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4748  site-specific recombinase, phage integrase family  28.14 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.830448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4220  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 475 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0478552  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4790  integrase family protein  25.59 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  22.25 
 
 		 457 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3513  hypothetical protein  21.9 
 
 		 507 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0489  tyrosine recombinase XerC  27.62 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.110232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1638  integrase family protein  23.9 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2528  tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.237042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1322  integrase family protein  24.68 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  25 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3678  hypothetical protein  22.52 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0167318  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.81 
 
 		 295 aa  57  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  22.22 
 
 		 304 aa  56.2  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  23.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  25.41 
 
 		 297 aa  56.2  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 		 298 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  54.7  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.1 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 299 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  20.77 
 
 		 306 aa  54.7  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  23.89 
 
 		 301 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0380  tyrosine recombinase XerC  24.31 
 
 		 304 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  24.02 
 
 		 305 aa  53.5  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 296 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4306  integrase/recombinase XerC  23.96 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  22.65 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  21.17 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  24.27 
 
 		 301 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  24.86 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  24.72 
 
 		 298 aa  52  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  25.41 
 
 		 322 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 318 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3993  tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3971  tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.84 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  22.51 
 
 		 291 aa  51.6  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3894  tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.41 
 
 		 299 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4087  tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 306 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0169707 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  25.84 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  23.86 
 
 		 299 aa  50.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.64 
 
 		 296 aa  50.4  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  24.77 
 
 		 299 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.24 
 
 		 302 aa  50.1  0.00008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.56 
 
 		 300 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  23.61 
 
 		 310 aa  50.1  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  24.88 
 
 		 302 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1673  integrase family protein  27.13 
 
 		 374 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.05 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  30.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  23.65 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  23.67 
 
 		 305 aa  49.7  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3428  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.89 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  24.29 
 
 		 300 aa  49.3  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2159  tyrosine recombinase XerD  22.51 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  24.72 
 
 		 324 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  23.19 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  26.01 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0447  tyrosine recombinase XerC  23.78 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.29 
 
 		 313 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  23.3 
 
 		 311 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  25 
 
 		 310 aa  48.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3580  tyrosine recombinase XerC  22.92 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.636062  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  22.53 
 
 		 308 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  20.76 
 
 		 307 aa  47.8  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.74 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  22.73 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  24 
 
 		 317 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 309 aa  47.4  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.99 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 295 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  24.53 
 
 		 300 aa  47.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  25.97 
 
 		 303 aa  47.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 309 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 309 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  23.46 
 
 		 318 aa  47  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  22.73 
 
 		 300 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  24.16 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.14 
 
 		 300 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>