16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3513 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3513  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  1044    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3678  hypothetical protein  25.87 
 
 		 487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0167318  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4748  site-specific recombinase, phage integrase family  25.11 
 
 		 474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.830448  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4220  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0478552  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4790  integrase family protein  25.38 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1638  integrase family protein  23.39 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.25 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0966  putative phage recombinase/integrase  21.9 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.37 
 
 		 300 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 296 aa  47  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  26.21 
 
 		 295 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.16 
 
 		 302 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.71 
 
 		 298 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  28.06 
 
 		 296 aa  43.9  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  26.09 
 
 		 295 aa  43.9  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.16 
 
 		 302 aa  43.9  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>