15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1638 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1638  integrase family protein  100 
 
 		 459 aa  940    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4220  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 475 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0478552  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4790  integrase family protein  27.27 
 
 		 488 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4748  site-specific recombinase, phage integrase family  26.95 
 
 		 474 aa  127  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.830448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3513  hypothetical protein  23.39 
 
 		 507 aa  103  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  23.06 
 
 		 457 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0966  putative phage recombinase/integrase  23.9 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  26.21 
 
 		 304 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3678  hypothetical protein  19.65 
 
 		 487 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0167318  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  26.41 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  20.89 
 
 		 372 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1201  hypothetical protein  23.79 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0198  hypothetical protein  23.79 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.525017  normal  0.648727 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.88 
 
 		 300 aa  43.1  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>