52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4220 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4220  phage integrase family protein  100 
 
 		 475 aa  982    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0478552  normal  0.746651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4790  integrase family protein  39.53 
 
 		 488 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4748  site-specific recombinase, phage integrase family  41.88 
 
 		 474 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.830448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1638  integrase family protein  26.3 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0966  putative phage recombinase/integrase  26.46 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3513  hypothetical protein  24.26 
 
 		 507 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.308433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6060  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.74 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.212116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  26.16 
 
 		 311 aa  54.3  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  22.06 
 
 		 305 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.73 
 
 		 311 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3678  hypothetical protein  20.38 
 
 		 487 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0167318  normal  0.0197508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3153  tyrosine recombinase XerD  23.6 
 
 		 443 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.5 
 
 		 296 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.73 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0747  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 303 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000635712  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.02 
 
 		 300 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.06 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.06 
 
 		 318 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  23.24 
 
 		 296 aa  48.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  25.18 
 
 		 301 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.6 
 
 		 314 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.03 
 
 		 300 aa  47.8  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.06 
 
 		 318 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.21 
 
 		 299 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05531  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.37 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  22.46 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  25.29 
 
 		 344 aa  46.6  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  23.65 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  27.07 
 
 		 305 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 324 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  19.85 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  19.85 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  21.18 
 
 		 318 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  19.85 
 
 		 300 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  24.55 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 299 aa  44.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1918  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.28 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.250204  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1924  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.28 
 
 		 369 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  23.9 
 
 		 308 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0306  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.28 
 
 		 366 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.28 
 
 		 366 aa  43.9  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  21.01 
 
 		 304 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  21.01 
 
 		 300 aa  43.9  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>