More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1210 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  100 
 
 		 379 aa  784    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3444  phage integrase family protein  39.36 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3483  phage integrase family protein  39.36 
 
 		 377 aa  293  2e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.561062  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6252  phage integrase-like SAM-like  30.93 
 
 		 381 aa  193  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6755  integrase family protein  32.69 
 
 		 392 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5720  integrase family protein  32.13 
 
 		 392 aa  187  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3609  site-specific recombinase, phage integrase family  35.17 
 
 		 340 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.608868  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6272  integrase family protein  31.58 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.419313 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7358  integrase family protein  30.86 
 
 		 402 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  normal  0.807102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1469  putative transposase  29.97 
 
 		 410 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0707219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0266  putative transposase  29.97 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7706  putative phage integrase  29.97 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.780364  normal  0.11828 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3328  putative transposase  29.97 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7315  putative transposase  29.97 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7404  putative phage integrase  29.97 
 
 		 385 aa  119  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4254  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 421 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0265726 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  25.71 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 367 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  26.02 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  25.23 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.58 
 
 		 295 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  25.35 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  27.11 
 
 		 328 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  24.83 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7364  integrase domain protein SAM domain protein  22.02 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  25.65 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  24.85 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6209  Phage integrase  29.5 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.16 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1870  phage integrase-like SAM-like  23.88 
 
 		 503 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.254784 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  24.85 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  25.72 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  25.83 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4577  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5287  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 495 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.970641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  23.24 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.94 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  25.41 
 
 		 373 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  24.58 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07060  site-specific recombinase XerD  24.63 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.273434 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2366  MutL protein  31.38 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00380657  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0189  phage integrase family protein  25.08 
 
 		 372 aa  63.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25.94 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.16 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  25.16 
 
 		 324 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  28.1 
 
 		 360 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  25.38 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  24.85 
 
 		 296 aa  62  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  26.57 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  25.08 
 
 		 315 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4222  integrase family protein  24.6 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  24 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  26.21 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00537  hypothetical protein  22.28 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  25.93 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  23.91 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  25.8 
 
 		 300 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  23.8 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  23.8 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.68 
 
 		 314 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  24.92 
 
 		 308 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  24.1 
 
 		 325 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  24.4 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1279  phage integrase family protein  24.19 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0644752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  28.24 
 
 		 295 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.56 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  25.37 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.94 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.66 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2670  integrase family protein  25.09 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  29.33 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2585  integrase family protein  25.09 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4728  integrase family protein  25.09 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  24.04 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.38 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  25.98 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  25.76 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  24.46 
 
 		 314 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0166  integrase domain-containing protein  21.75 
 
 		 474 aa  57  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>